Пресс-центр / Дайджест
Картирование поверхности наночастиц для рационального дизайна систем доставки лекарств
Для достижения контроля над образованием биомолекулярной короны необходимо контролировать поверхностные свойства наночастиц (НЧ). Однако для этого необходимо разработать подходы для исследования структуры и динамики поверхности НЧ с высоким разрешением. Сотрудники ИБХ РАН и ИК РАН предложили метод картирования поверхности НЧ, основанный на данных МД моделирования, и применили его для анализа структуры и динамики поверхности лиганд-содержащих НЧ типа «ядро-оболочка». Показано, что построение карт поверхности НЧ позволяет оценивать свойства, важные для систем доставки лекарств. Работа опубликована в журнале Biomaterials Science. Препринт доступен в ChemRxiv.
Фотография автономно светящихся Arabidopsis thaliana, демонстрирующих улучшенную версию пути биолюминесценции грибов, была выбрана в качестве обложки выпуска Nature Methods (том 21, выпуск 3, 2024). Подробнее о работе
Функциональное исследование роли белков RPF1 и EFS1 в процессинге пре-рРНК и сборке прерибосомных частиц
Сотрудники Отдела функционирования живых систем ИБХ РАН показали участие ранних (ядрышковых) факторов биогенеза рибосом RPF1 и ESF1 в созревании рибосомных субъединиц. Нокдаун с помощью экспрессии shRNA продемонстрировал уникальное изменение профиля пре-рРНК в ответ на стресс биогенеза рибосом. Дефицит данных белков в клетках человека, в отличие от клеток дрожжей, не является фатальным, что позволяет утверждать о вероятных перестройках процесса для поддержания трансляционной активности клеток. На основании полученных результатов авторы предполагают, что белки RPF1 и ESF1 выполняют структурную функцию и способствуют правильному фолдингу РНК-белковых комплексов для дальнейших стадий процессинга пре-рРНК. Работа опубликована в журнале Cells. Подробнее
Новые Obolenskvirus-подобные фаги Brutus и Scipio: биология, эволюция и взаимодействие фага с хозяином
Сотрудники Лаборатории молекулярной биоинженерии ИБХ РАН совместно с коллегами из других российских институтов выделили и изучили два новых вирулентных фага рода Obolenskvirus, инфицирующих Acinetobacter baumannii, значимый нозокомиальный патоген. Фаги Brutus и Scipio смогли инфицировать штаммы A. baumannii, относящиеся к капсульным типам К116 и К82 соответственно. Авторы Охарактеризовали биологические свойства и геномную организацию фагов, и провели сравнительный геномный, филогенетический и пангеномный анализы. Также было проведено исследование ферментативной активности деполимеразы хвостового шипа, кодируемой в геноме фага Scipio - первого зарегистрированного вируса, инфицирующего A. baumannii капсульного типа К82. Изучение новых представителей рода Obolenskvirus, расширяет знания о разнообразии вирусов внутри этой таксономической группы и стратегиях взаимодействия фагов Obolenskvirus с бактериями-хозяевами. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences.
Осуществлен рациональный дизайн высокоэффективного биокатализатора для фосфорибозилирования противовирусных производных пиразин-2-карбоксамида
Противовирусные препараты T-1105 и T-705 (Фавипиравир) являются неактивными пролекарствами, которые подвергается метаболическому превращению in vivo в активную форму посредством фосфорибозилирования. Эффективность этого процесса в клетках человека крайне низка, что делает актуальной задачу получения фосфорибозилированных производных пиразин-2- карбоксамида in vitro. Сотрудники Отдела биотехнологии ИБХ РАН совместно с коллегами из МГУ и ФНИЦ «Кристаллография и фотоника» РАН создали высокоэффективный биокатализатор на основе гипоксантин-гуанинфосфорибозилтрансферазы из T. thermophilus (TthHGPRT). В результате рационального дизайна активного центра TthHGPRT был получен мутант D106G/Y155W с 325- кратным увеличением скорости синтеза фосфорибозида T-705 и 125-кратным – фосфорибозида T- 1105. Полученные результаты могут послужить основой для создания новых ферментативных технологий получения противовирусных соединений. Работа опубликована в журнале ACS Catalysis. Подробнее