Пресс-центр / Дайджест
Новые хаотропные смеси позволили упростить получение геномной ДНК из грибов для ПЦР
Исследователи из Лаборатории нейрорецепторов и нейрорегуляторов ИБХ РАН усовершенствовали метод получения образцов геномной ДНК из грибов для ПЦР-диагностики. Авторами проведен поиск специальных хаотропных смесей для получения высокоочищенных клеточных оболочек с ДНК за счет высокотемпературной экстракции РНК, белков и низкомолекулярных компонентов из биомассы дрожжей. Наиболее эффективной оказалась хаотропная смесь на основе 7М мочевины, 1% SDS, 100 мМ аммиака и 25 мМ цитрата натрия. Ее использование обеспечивало практически полное удаление РНК и липидов за 10 минут, и одностадийное получение ДНК-содержащих клеточных чехлов, которые можно непосредственно добавлять в реакционную смесь для ПЦР без дополнительной пробоподготовки. Разработанный подход перспективен для ПЦР-диагностики и таксономических исследований грибов и других микроорганизмов с прочной клеточной стенкой. Исследование опубликовано в журнале Analytica Chimica Acta. Подробнее
Увеличение интенсивности флуоресценции хромофора GFP путем введения трифтор-метильной группы
Как правило, существенное изменение свойств химических веществ требует не менее существенного изменения их строения – введения электронно-донорных или электроноакцепторных групп, замыкания новых циклов и введения новых гетероатомов. Тем не менее, иногда из этого правила бывают исключения. Так, учеными из Группы химии гетероциклических соединений и Лаборатории оптического биоимиджинга ИБХ РАН было показано, что введение в молекулы хромофора GFP трифтор-метильной группы вместо метильной позволяет существенно увеличить интенсивность их флуоресценции. Ранее подобного эффекта удавалось достигнуть только трудоемким введением мостиковых групп или существенным изменением природы заместителей в молекуле. Полученные вещества не только являются яркими флуорофорами, но и могут быть использованы для селективного мечения ЭПР в живых клетках. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences.
Роль механизма переноса энергии в наноинициаторе для ИК-индуцируемой полимеризации
Сотрудники Лаборатории полимеров для биологии ИБХ РАН совместно с коллегами из ФНИЦ «Кристаллография и фотоника» РАН и др. институтов продемонстрировали эффективную стратегию полимеризации фотоотверждаемых композиций с использованием наноинициатора на основе апконвертирующих наночастиц (UCNP), активируемого светом из ближнего ИК-диапазона. UCNPs, преобразующие ИК-свет в УФ- и видимое излучение, использовали для исследования механизма переноса энергии в паре донор-акцептор с коммерчески доступными фотоинициаторами (LAP и Irgacure 369). Определено влияние механизма передачи энергии на пространственное разрешение получаемых структур, продемонстрировано фотоотверждение эндогенных биополимеров (желатина и гиалуроновой кислоты). Работа опубликована в журнале Materials Today Advances. Подробнее
Растительная поли (АДФ-рибоза) полимераза 1 является потенциальным медиатором взаимодействия между белком телец Кахаля, коилином, и механизмом противовирусной защиты, опосредованным салициловой кислотой
Ядрышки и тельца Кахаля (ТК) представляют собой субъядерные структуры с широко известной функцией в процессах метаболизма РНК. Сотрудники Лаборатории функциональной геномики и протеомики растений ИБХ PAH совместно с коллегами из Института Джеймса Хаттона (Великобритения) описали новый механизм, с помощью которого эти структуры обеспечивают защиту растений от вирусов. Показано, что белок ТК, коилин, взаимодействует с поли(АДФ-рибоза) полимеразой 1, релокализует этот фермент в ядрышко и модифицирует его функцию, что вызывает активацию механизма противовирусной защиты, контролируемого салициловой кислотой. Работа опубликована в журнале Viruses.
Влияние белковой короны противоопухолевых липосом, несущих лиганд селектинов Sialyl Lewis X, на взаимодействия с эндотелиальными клетками в условиях биомоделирования микрососудов
Сотрудниками Отдела химической биологии гликанов и липидов совместно с коллегами из Института общей патологии и патофизиологии РАН, НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи и НИИ биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича исследовано влияние белковой короны адресных липосом на интернализацию эндотелиальными клетками в условиях моделирования микрососудов в микрофлюидном устройстве. Показано, что липосомы, оснащенные тетрасахаридным лигандом селектинов SiaLe X , сохраняют способность к нацеливанию на активированные эндотелиоциты в динамических условиях микропотока. Однако в потоке сыворотки крови человека уровень поглощения липосом клетками понижается. С помощью протеомного анализа и иммуноблоттинга липосом-белковых комплексов установлена корреляция между содержанием SiaLe X и некоторых аполипопротеинов, в том числе вероятных неспецифических конкурентов селектинов. Работа опубликована в журнале Pharmaceutics.