Институт
биоорганической химии

Недавно команде ученых из Лаборатории молекулярной онкологии ИБХ РАН в сотрудничестве с коллегами из других российских институтов удалось установить, что теломеразная РНК человека, считавшаяся некодирующей, обладает кодирующим потенциалом. В клетках человека существует несколько изоформ транскрипта теломеразной РНК, а экспрессия гена hTERC не прекращается при инактивации теломеразы. Ученые предположили, что биогенез первичного транскрипта должен определять, какую функцию будет выполнять конечный продукт экспрессии гена теломеразной РНК человека. Анализируя влияние различных факторов биогенеза РНК на процессинг и транспорт теломеразной РНК человека, авторы выявили, что в условиях ингибирования механизма деградации полиаденилированных РНК происходит накопление в цитоплазме удлиненной формы теломеразной РНК человека, т.е. мРНК, кодирующей выявленный нами ранее белок hTERP. Работа опубликована в журнале Biomedicines.

Нейротрофины и их рецепторы регулируют дифференцировку, выживаемость и рост нервных клеток. Несмотря на их центральную роль в жизни нейронов, механизмы, лежащие в основе передачи сигнала внутрь клетки, до сих пор не до конца изучены. Согласно одной из основных гипотез, в результате связывания с лигандом димер нейротрофинового рецептора Trk претерпевает ряд перестроек, которые и запускают сигнальные каскады внутри клетки. Однако, структурных данных, подтверждающих эту идею, до сих пор не было. Сотрудники Лаборатории биомолекулярной ЯМР-спектроскопии ИБХ РАН и Института биомедицины в Валенсии обнаружили два состояния трансмембранного домена, которые, по-видимому, отвечают за активное и неактивное состояние рецептора. Кроме того, оказалось, что протяженный внеклеточный примембранный регион является неупорядоченным. Это позволило предположить, что передача сигнала возможна, если лиганд непосредственно связывается с этим участком рецептора, тем самым стабилизируя его. Работа опубликована в журнале iScience.

Совместная работа Лаборатории биофармацевтических технологий ИБХ РАН с коллегами из Лаборатории биологических испытаний ФИБХ РАН по разработке и тестированию новых антитромботических препаратов белковой природы из кровососущих организмов. В качестве потенциальных антикоагулянтов были выбраны гемадин из пиявки Haemadipsa sylvestris, вариегин из клеща Amblyomma variegatum и анофелин из малярийного комара Anopheles albimanus. Были разработаны технологии получения всех рекомбинантных препаратов с биофармацевтической чистотой. В качестве объекта сравнения были использован рекомбинантный гирудин-1 из Hirudo medicinalis, внедренный в антитромботическую терапию под торговым названием Iprivask (Aventis Pharmaceuticals, USA). Была исследована антитромботическая активность всех полипептидов с использованием теста по оценке прямого ингибирования активности тромбина и коагуляционных тестов на человеческой и мышиной плазме. Продемонстрирован высокий потенциал гемадина и вариегина, как прямых ингибиторов тромбина. Статья была опубликована в журнале Biomedicines (IF 6.081).

Совместная работа сотрудников Лаборатории биофармацевтических технологий ИБХ РАН с коллегами из Института Молекулярной биологии им. Энгельгардта (ИМБ РАН) по разработке эффективного метода препаративного синтеза модифицированных пурин 2'-дезоксирибонуклеозидов. Для этого был проведен сравнительный анализ условий реакции трансгликозилирования, катализируемой пурин (PNP) и тимидин (TP) нуклеозидфосфорилазами, приводящих к образованию 2'-дезоксинуклеозидов. Показано, что максимальные выходы 2'-дезоксинуклеозидов, особенно модифицированных, достигаются при небольшом избытке гликозил-донора (7-метил-2'-дезоксигуанозин, тимидин) и четырехкратном недостатке фосфата. Концентрация фосфата менее эквимолярной позволяет использовать лишь небольшой избыток нуклеозида - донора углеводного остатка для увеличения выхода реакции. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences (IF 5.924)

Команда ученых из Лаборатории молекулярной биоинженерии ИБХ РАН совместно с коллегами из других российских институтов были предсказала и получила несколько различных рекомбинантных деполимераз, закодированных в профаговых областях генома Acinetobacter baumannii. Для двух деполимераз определена специфичность к капсулярным полисахаридам (КПС) A. baumannii, относящимся к капсульным типам К1 и К92 (К-типы). Полученные данные показали, что деполимеразы профага представляют собой гликозидазы, расщепляющие КПС A. baumannii с образованием мономеров и олигомеров K-звеньев. Рекомбинантные белки с установленной ферментативной активностью значительно снижали смертность личинок Galleria mellonella, инфицированных A. baumannii капсульных типов К1 и К92. Эти ферменты можно рассматривать как подходящие кандидаты для разработки новых антибактериальных средств против соответствующих типов K A. baumannii. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences. Подробнее