Институт
биоорганической химии

Российские ученые представили обзор современных клеточных моделей преэклампсии — опасного осложнения беременности. Исследование охватывает двухмерные и трехмерные культуры, а также передовые технологии с использованием микрофлюидной модели плаценты-на-чипе, позволяющие изучать патологические механизмы на клеточном уровне. В работе подчеркивается потенциал CRISPR-Cas9 и персонализированных моделей для разработки новых методов диагностики и терапии преэклампсии. Эти достижения открывают перспективы более точной и ранней диагностики преэклампсии, а также создания эффективных стратегий лечения. Работа опубликована в журнале BioChip Journal. Подробнее

Применение фотоотверждаемых гидрогелей в качестве биоматериалов является одной из задач тканевой инженерии. В нашей работе, проделанной учёными из ИБХ РАН и других институтов, мы предлагаем вместо традиционных УФ-фотоинициаторов использование производных фотосенсибилизаторов – хлорина р6, хлорина е6 и фталоцианина – в сочетании с соинициаторами дитиотреитолом или 2-меркаптоэтанолом, которые активируют реакцию фотосшивки гелей внутри организма при облучении светом из красного диапазона (660-670 нм), попадающим в окно прозрачности тканей. Продемонстрировано формирование in vitro и in vivo фотосшитых гелей из гиалуроновой кислоты. Такие гели обладали модулем Юнга (~270-460 кПа), типичным для мягких тканей, и сохраняли в организме свою форму и размер в течение месяца.Работа поддержана грантом РНФ 21-79-10384 и опубликована в журнале Biomaterials science.

Ученые из ГНЦ ИБХ РАН в сотрудничестве с другими институтами установили уникальную структуру аптамера к гемагглютинину вируса гриппа А. Авторы показали, что исходный аптамер BV42, содержащий протяженный фрагмент из остатков цитозина, образует одну из разновидностей неканонических структур нуклеиновых кислот – i-мотив. Однако конформационная гетерогенность BV42 затрудняла детальный структурный анализ. Использование компьютерных методов и химической модификации помогли выявить потенциальный сайт связывания и применить уникальный подход к устранению конформационного разнообразия при сохранении высокого сродства к мишени. ЯМР спектроскопия подтвердила уникальную структуру оптимизированного аптамера, содержащую i–мотивный и дуплексный модуль. Полученные результаты представляют собой значительный прогресс в рациональном дизайне аптамеров, подчеркивая функциональный потенциал i-мотивов для специфического распознавания белков в физиологических условиях. Работа опубликована в Nucleic Acids Research.

Сотрудники четырех научных институтов, включая ФИЦ Биотехнологии РАН, ИМБ РАН, ГНЦ ИБХ РАН и ИБГ РАН, изучили профиль связывания фактора транскрипции Kaiso в геноме человека. Несмотря на активное исследование его роли в клональном гемопоэзе, распределение Kaiso на хроматине оставалось неясным. Для анализа использовали клетки светлоклеточной карциномы почки Caki1 и Kaiso-дефицитные клетки. Данные по метилированию ДНК, транскриптомике и ChIP-seq показали, что Kaiso преимущественно связывается с мотивами CGCG и CTGCNAT, при этом 60% сайтов содержат обе последовательности. Мутантный вариант E535A подтвердил специфичность взаимодействия с метилированными регионами. Выявлены гены-мишени, включая SQSTM1, участвующий в дифференцировке клеток миелоидного лейкоза. Также обнаружен новый класс CpG-островков с волнообразным профилем метилирования. Исследование подчеркивает сложный профиль взаимодействия Kaiso с ДНК и его важную роль в регуляции экспрессии генов. Работа опубликована в журнале Epigenetics & Chromatin. Подробнее

Иммунный ответ NK-клеток на вирус SARS-CoV-2 в контексте формирования иммунологической памяти малоизучен. Ученые из ИБХ РАН в сотрудничестве с коллегами из других институтов установили SARS-CoV-2-специфический характер реакций NK-клеток у лиц, перенесших COVID-19. При стимуляции пептидами SARS-CoV-2 у таких доноров был продемонстрирован повышенный уровень активации, дегрануляции, продукции IFNγ и пролиферации NK-клеток, а также выявлено усиление экспрессии генов, участвующих в транспорте белков, метаболизме и иммунном ответе. Увеличенный уровень экспрессии гена, кодирующего активирующий рецептор KIR2DS4, коррелировал с усиленным ответом NK-клеток на пептиды SARS-CoV-2, что указывает на возможную роль этого рецептора в распознавании SARS-CoV-2. Работа поддержана грантом РНФ 22-15-00503 и опубликована в журнале Journal of Medical Virology.