Пресс-центр / Дайджест
Классификация змеиных ядов с помощью рамановской спектроскопии
Змеиные яды представляют собой сложные, преимущественно белковые, смеси. Для оценки состава змеиных ядов, команда ученых из Отдела молекулярной нейроиммунной сигнализации ИБХ РАН, совместно с коллегами из ИОФ РАН, предложила метод, основанный на рамановской спектроскопии, который не требует предварительной подготовки образцов, а их необходимое для анализа количество крайне мало. Рамановский спектр белка содержит уникальную информацию о его первичной и вторичной структурах. Авторы провели исследование сухих ядов различных видов змей из разных родов и семейств. На основе полученных спектров, с помощью математических методов, проведены классификация ядов, отражающая их состав, и отнесение ядопродуцирующей змеи к соответствующему семейству или даже роду. Предлагаемый метод может быть использован для анализа состава и вариаций ядов. Результаты опубликованы в журнале Journal of Materials Chemistry B. Подробнее
Полный синтез рацемического трикарбоксилата тиено[3,2-f]тиохромена – люциферина морских полихет Odontosyllis undecimdonta
Люциферин биолюминесцентной системы Odontosyllis undecimdonta, обладающей характерным зелено-голубым свечением, представляет собой необычный серосодержащий гетероцикл, аналоги которого ранее не были известны. Несмотря на обилие методов синтеза бензотиофенов и тиохроменов, синтетических подходов к тиено[3,2-f]тиохроменам до настоящего времени предложено не было. Сотрудниками Лаборатории химии метаболических путей был разработан конвергентный подход к синтезу трикарбоксилата тиено[3,2-f]тиохромена, основанный на тандемных реакциях с использованием бифункциональных реагентов, что позволило подтвердить структуру природного люциферина Odontosyllis undecimdonta и открыло путь к синтезу других ранее недоступных тиено[3,2-f]тиохроменов. Работа опубликована в журнале Organic Letters. Подробнее
Влияние кардиотоксинов кобры на внутриклеточный кальций и контрактуру кардиомиоцитов крысы зависит от их структурных типов
Ученые Отдела молекулярной нейроиммунной сигнализации ИБХ РАН совместно с коллегами из Института биофизики клетки и Института теоретической и экспериментальной биофизики изучили влияние кардиотоксинов яда кобр на внутриклеточную концентрацию ионов кальция и форму кардиомиоцитов крысы (CaTx). В зависимости от структуры N-концевой или центральной полипептидной петли CaTx классифицируют либо на группы I и II, либо на P- и S-типы соответственно. Показано, что СаТх группы I, содержащие два соседних остатка пролина в N- концевой петле, менее токсичны для кардиомиоцитов, чем токсины группы II, а СаТх S-типа менее активны, чем Р-типа. Таким образом, показано, что токсичность CaTx в отношении кардиомиоцитов зависит от строения как N-концевой, так и центральной полипептидной петли. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences. Подробнее
Изменения в субпопуляциях CD56– и CD56+ Т-клеток при COVID-19
Ученые из ИБХ РАН, совместно с коллегами из ИМБ РАН и университета Сириус, провели сравнительный анализ фракций циркулирующих CD56+ NKT-подобных клеток, сочетающих в себе свойства Т- и NK-клеток, и CD56– T-лимфоцитов при COVID-19 среди пациентов отделений интенсивной терапии (ОРИТ), пациентов со средней степенью тяжести и реконвалесцентов. Пациенты ОРИТ с летальным исходом имели сниженное содержание NKT-подобных клеток, что свидетельствует о потенциальной роли этой клеточной фракции в патогенезе COVID-19. Ученые предлагают рассматривать уменьшение доли NKG2D+ и NKG2A+ клеток и повышение экспрессии PD-1 и HLA-DR как в CD56–, так и в CD56+ Т-клетках как маркеры прогрессии COVID-19. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences.
Внутримолекулярная водородная связь в N6-замещенных 2-хлораденозинах по данным ЯМР-спектроскопии
В спектрах ЯМР N6-замещенных 2-хлораденозинов были обнаружены две формы. Доля мини-формы составляла 11–32% от основной. Мини-форма характеризуется отдельным набором сигналов в спектрах ЯМР. Команда ученых из ИБХ РАН предположила, что она возникает за счет внутримолекулярной водородной связи между протоном N6-CH заместителя и атомом N7 пурина. Спектр 15N-HMBC подтвердил наличие водородной связи в мини-форме нуклеозида и ее отсутствие в основной форме. Были синтезированы соединения, в которых образование такой водородной связи невозможно. В них отсутствовал либо атом N7 пурина, либо протон N6–CH заместителя. В спектрах ЯМР этих нуклеозидов мини- форма не обнаружена, что подтверждает необходимость образования внутримолекулярной водородной связи для появления мини-формы. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences.