Пресс-центр / Дайджест
Структура и особенности функционирования Lon-протеаз из разных организмов
Сотрудники Лаборатории химии протеолитических ферментов ИБХ РАН совместно с коллегами из Национального института онкологии (Фредерик, США) опубликовали статью, посвященную структурным исследованиям АТР-зависимых Lon-протеаз – ключевых участников системы контроля качества клеточных белков, мишенями которых служат мутантные, поврежденные и некоторые регуляторные белки. В семействе Lon выявлено три подсемейства, представители которых образованы АТР-азными доменами (суперсемейство ААА+-белков), серин–лизиновыми пептидазами и различающимися неактивными экстрадоменами. Бочкообразные гексамеры Lon-протеаз связывают белковые мишени, разворачивают и перемещают во внутреннюю деградационную камеру, где они подвергаются протеолизу. С помощью 3D-анализа получены данные о структуре как индивидуальных доменов, так и мультидоменных фрагментов Lon-протеаз разных подсемейств. Использование крио-электронной микроскопии позволило определить структуры ряда полноразмерных Lon-протеаз, а также описать состояние ферментов на разных стадиях каталитического цикла. Работа опубликована в журнале Journal of Molecular Biology.
Генетически кодируемая система, основанная на биолюминесцентном резонансном переносе энергии, для фотодинамической терапии глубинных опухолей
Сотрудники Отдела иммунологии и Отдела пептидно-белковых технологий совместно ИБХ РАН с коллегами из НПП «Питомник лабораторных животных», ИОФ РАН и НИЯУ МИФИ разработали генетически кодируемую BRET-пару «внутренний источник света-фотосенсибилизатор» NanoLuc-miniSOG, которая, будучи нацеленной на раковые клетки, позволяет проводить BRET-активированную ФДТ для лечения глубинных опухолей. Работа опубликована в журнале Light: Science & Applications. Подробнее
Исследования вариабельности числа копий фрагментов ДНК по данным высокопроизводительного секвенирования
Традиционно для детекции хромосомных аномалий применяют цитогенетические и молекулярно-цитогенетические методы. С развитием технологий секвенирования стали доступны новые подходы, позволяющие идентифицировать структурные вариации размером от 50 пн. Сотрудники Лаборатории молекулярной онкологии ИБХ РАН совместно с коллегами из ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России разработали подход для формирования валидационного набора на уровне экзонов и оценили эффективность алгоритмов, предназначенных для данных полноэкзомного секвенирования. Работы опубликованы в журналах Scientific Reports и International Journal of Molecular Sciences. Подробнее
7,8-дигидро-8-оксо-1,N6-этеноаденин: миметик тимина, спаривающийся исключительно Хугстиновской стороной в ДНК, который вызывает трансверсии A → T в Escherichia coli
Сотрудники Группы молекулярных инструментов для исследования живых систем и Лаборатории молекулярной диагностики ИБХ РАН с коллегами из Сколтеха, ФНКЦ физико-химической медицины, Массачусетского технологического института (США) и института химической физики «Рокасолано» (Испания) разработали ДНК модификацию, 7,8-дигидро-8-оксо-1,N6-этеноаденин (оксо-ϵA), не встречающееся в природе синтетическое основание, сочетающее в себе структурные особенности двух природных повреждений ДНК (7,8-дигидро-8-оксоаденин и 1,N6-этеноаденин). Способность оксо-ϵA имитировать природное основание тимин и регулировать стабильность дуплексов, а также ее сильная флуоресценция и невидимость для ферментативных систем репарации in vivo являются свойствами, которые могут найти применение в разработке молекулярных инструментов и терапевтических средств на основе нуклеиновых кислот. Работа опубликована в журнале Nucleic Acids Research.
Определены возможные механизмы действия силиконовых и золотых наночастиц на дифференцировку стволовых клеток
Сотрудники Лаборатории клеточных взаимодействий, Отдела биоматериалов и бионанотехнологий и Учебно-научного центра с коллегами из МИФИ и Центра матери и ребенка им. Кулакова провели анализ механизмов стимуляции остеогенной и подавления адипогенной дифференцировки стволовых клеток под действием силиконовых и золотых наночастиц. Авторы выявили два основных механизма действия наночастиц: стимуляцию экспрессии CD13 и CD90 и влияние на уровень G-CSF и VEGF в процессе остеогенной дифференцировки МСК. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Science.