Пресс-центр / Дайджест
Профаговые области в куртобактериальных геномах: мал золотник, да дорог
Curtobacterium — род грамположительных бактерий порядка Actinomycetales. Некоторые виды Curtobacterium являются патогенами сельскохозяйственных культур, таких как соя, сухие бобы, горох, сахарная свекла и столовая свекла, которые встречаются во всем мире. Около 200 геномов видов Curtobacterium, включая метагеномные последовательности, были проверены на наличие последовательностей возможного профагового происхождения. Один из предсказанных умеренных фагов был индуцирован из генома Curtobacterium. Биоинформатический анализ смоделированных белков, кодируемых в областях, происходящих от профагов, привел к обнаружению около 100 ферментов, разрушающих гликополимеры. Эти белки могут быть рассмотрены для экспериментального дизайна новых антибактериальных средств против фитопатогенов Curtobacterium. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences. Подробнее
Использование комплексного подхода, включающего предсказания AlphaFold, для эволюционной таксономии вирусов реалма Duplodnaviria
Классификация высокоранговых таксонов, включая семейства и отряды – важная задача для таксономии вирусов реалма Duplodnaviria. В настоящем исследовании сотрудники Лаборатории молекулярной инженерии ИБХ РАН совместно с коллегами из Лимнологического института СО РАН проанализировали эволюционные отношения консервативных вирусных белков, представляющих различные вирусы, включая все классифицированные семейства Duplodnaviria. Анализ был проведен с использованием предсказаний AlphaFold, структурных сравнений и различных филогенетических методов. Результаты анализов указывали на, в целом, высокое качество моделирования с помощью AlphaFold и возможность использования предсказаний AlphaFold, совместно с другими методами, для реконструкции эволюционных взаимоотношений между отдаленными группами вирусов. Работа опубликована в журнале Biomolecules. Подробнее
Хемогенетически индуцированный окислительный стресс в нейронах снижает синаптическую пластичность
Нарушение функций мозга при старении и нейродегенеративные заболевания с неясной этиологией такие, как болезнь Альцгеймера, всегда сопровождаются окислительным стрессом нервных клеток. Вопрос о том, что является ли окислительный стресс причиной таких патологических состояний или же представляет собой вторичное явление, остается до сих пор открытым из-за отсутствия методов для моделирования изолированного окислительного стресса. С помощью хемогенетического инструмента на основе дрожжевой оксидазы D-аминокислот сотрудники Группы редокс-биологии и Лаборатории молекулярных технологий Отдела метаболизма и редокс-биологии ИБХ РАН совместно с коллегами из ФЦМН ФМБА России и РНИМУ им. Н.И. Пирогова смоделировали окислительный стресс в отдельных пирамидных нейронах и показали, что он подавляет долговременную потенциацию, одну из форм клеточной памяти. Полученные результаты позволяют установить связь между окислительным стрессом в нейронах и нарушениями обучения и памяти. Работа опубликована в журнале Redox Biology. Подробнее
Изучено влияние старения контрастных наночастиц для МРТ в организме
Группа ученых из Лаборатории молекулярной иммунологии ИБХ РАН, ИОФ РАН и ряда других научных институтов провели исследование биотрансформации магнитных наночастиц в организме и влияния этого процесса как на метаболизм железа, так и на уменьшение контрастных свойств наночастиц при визуализации. Долгое время оставалось неясным, что в долгосрочной перспективе происходит с наночастицами-контрастами для МРТ после их распределения по тканям, при том, что процессы биодеградации наноматериалов, сопровождающиеся обильным выделением ионов железа, могут токсически влиять на сам организм. Новое исследование, опубликованное в высокорейтинговом журнале Journal of Nanobiotechnology, позволило прояснить этот вопрос. Подробнее
Российские биологи открыли новый тип взаимодействия змеиных α-нейротоксинов с никотиновыми ацетилхолиновыми рецепторами
Коллектив российских биологов с участием сотрудников ИБХ РАН, НИЦ «Курчатовский Институт», Института биомедицинской химии и биологического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова изучил, как взаимодействуют змеиные «необычные» α-нейротоксины с никотиновыми ацетилхолиновыми рецепторами животных. Оказалось, что они взаимодействуют принципиально иным образом в сравнении с классическими змеиными трехпетельными α-нейротоксинами. Учёные подробно описали открытый новый тип взаимодействия в публикации в журнале Communications Biology (из группы Nature). Исследование проходило при поддержке гранта РНФ (проект № 19-74-20163). Подробнее