Пресс-центр / Дайджест
Использование комплексного подхода, включающего предсказания AlphaFold, для эволюционной таксономии вирусов реалма Duplodnaviria
Классификация высокоранговых таксонов, включая семейства и отряды – важная задача для таксономии вирусов реалма Duplodnaviria. В настоящем исследовании сотрудники Лаборатории молекулярной инженерии ИБХ РАН совместно с коллегами из Лимнологического института СО РАН проанализировали эволюционные отношения консервативных вирусных белков, представляющих различные вирусы, включая все классифицированные семейства Duplodnaviria. Анализ был проведен с использованием предсказаний AlphaFold, структурных сравнений и различных филогенетических методов. Результаты анализов указывали на, в целом, высокое качество моделирования с помощью AlphaFold и возможность использования предсказаний AlphaFold, совместно с другими методами, для реконструкции эволюционных взаимоотношений между отдаленными группами вирусов. Работа опубликована в журнале Biomolecules. Подробнее
Хемогенетически индуцированный окислительный стресс в нейронах снижает синаптическую пластичность
Нарушение функций мозга при старении и нейродегенеративные заболевания с неясной этиологией такие, как болезнь Альцгеймера, всегда сопровождаются окислительным стрессом нервных клеток. Вопрос о том, что является ли окислительный стресс причиной таких патологических состояний или же представляет собой вторичное явление, остается до сих пор открытым из-за отсутствия методов для моделирования изолированного окислительного стресса. С помощью хемогенетического инструмента на основе дрожжевой оксидазы D-аминокислот сотрудники Группы редокс-биологии и Лаборатории молекулярных технологий Отдела метаболизма и редокс-биологии ИБХ РАН совместно с коллегами из ФЦМН ФМБА России и РНИМУ им. Н.И. Пирогова смоделировали окислительный стресс в отдельных пирамидных нейронах и показали, что он подавляет долговременную потенциацию, одну из форм клеточной памяти. Полученные результаты позволяют установить связь между окислительным стрессом в нейронах и нарушениями обучения и памяти. Работа опубликована в журнале Redox Biology. Подробнее
Изучено влияние старения контрастных наночастиц для МРТ в организме
Группа ученых из Лаборатории молекулярной иммунологии ИБХ РАН, ИОФ РАН и ряда других научных институтов провели исследование биотрансформации магнитных наночастиц в организме и влияния этого процесса как на метаболизм железа, так и на уменьшение контрастных свойств наночастиц при визуализации. Долгое время оставалось неясным, что в долгосрочной перспективе происходит с наночастицами-контрастами для МРТ после их распределения по тканям, при том, что процессы биодеградации наноматериалов, сопровождающиеся обильным выделением ионов железа, могут токсически влиять на сам организм. Новое исследование, опубликованное в высокорейтинговом журнале Journal of Nanobiotechnology, позволило прояснить этот вопрос. Подробнее
Российские биологи открыли новый тип взаимодействия змеиных α-нейротоксинов с никотиновыми ацетилхолиновыми рецепторами
Коллектив российских биологов с участием сотрудников ИБХ РАН, НИЦ «Курчатовский Институт», Института биомедицинской химии и биологического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова изучил, как взаимодействуют змеиные «необычные» α-нейротоксины с никотиновыми ацетилхолиновыми рецепторами животных. Оказалось, что они взаимодействуют принципиально иным образом в сравнении с классическими змеиными трехпетельными α-нейротоксинами. Учёные подробно описали открытый новый тип взаимодействия в публикации в журнале Communications Biology (из группы Nature). Исследование проходило при поддержке гранта РНФ (проект № 19-74-20163). Подробнее
Идентификация эпитопов, распознаваемых Т-клеточным рецептором, ассоциированным с анкилозирующим спондилитом
Ученым из Лаборатории сравнительной и функциональной геномики ИБХ РАН совместно с коллегами из университетов Стэнфорда, Оксфорда и университета Дж. Вашингтона в Сент-Луисе, удалось установить полную структуру для ассоциированных с анкилозирующим спондилоартритом (АС) рецепторов Т-лимфоцитов (TCR), и определить узнаваемые ими эпитопы (антигены). С помощью рентгеноструктурного анализа нескольких комплексов ТCR с соответствующими комплексами пептид-МНС удалось определить ключевые аминокислотные остатки, определяющие узнавание антигенных пептидов. Распознаваемые Т-клеточные эпитопы были найдены в последовательностях белков человека и ряда кишечных бактерий. Полученные результаты поддерживают гипотезу кросс-реактивности Т-клеток при узнавании микробных антигенов и антигенов клеток собственного организма как механизма запуска аутоиммунной реакции при АС. Работа опубликована в журнале Nature. Подробнее