Институт
биоорганической химии

Коллектив исследователей из ГНЦ ИБХ РАН совместно с коллегами из ФИЦ Биотехнологии РАН и ЦНИИ туберкулёза провёл комплексное исследование роли малых РНК MTS1338 и MTS0997 в патогенезе туберкулёза. Полученные результаты показали, что эти молекулы участвуют в регуляции метаболизма и вирулентности M. tuberculosis, а также способны модифицировать иммунный ответ хозяина. Таким образом, MTS1338 и MTS0997 могут рассматриваться как факторы, координирующие взаимодействие микобактерий с организмом хозяина, и как потенциальные мишени для разработки новых подходов к противотуберкулёзной терапии. Работа выполнена при поддержке гранта Российского научного фонда № 22-14-00235 и опубликована в журнале Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. Подробнее

Ученые создали генетически кодируемый инструмент Grubraw, который способен генерировать в матриксе митохондрий пируват – один из главных субстратов окислительного метаболизма. Активность Grubraw увеличивала интенсивность аэробного метаболизма митохондрий в опухолевых клетках и замедляла скорость роста опухолевых клеток в культуре и в модели ксенотрансплантатов в мышах. При этом наблюдалось уменьшение транскрипции генов, связанных с репликацией ДНК и пролиферацией. Кроме того, оказалось, что опухолевые клетки противодействуют влиянию Grubraw, выводя часть сгенерированного пирувата во внеклеточную среду. Результаты исследования, поддержанного грантом РНФ № 23-75-30023, опубликованы в журнале Nature Chemical Biology. Подробнее

Впервые показано, что системин, изначально открытый как октадекапептидный регулятор стрессовых реакций растений в ответ на атаку фитофагов, — обладает защитным потенциалом против вирусных патогенов. В контролируемых условиях проводилось искусственное заражение коммерческого сорта картофеля Индиго наиболее вредоносным, экономически значимым Y вирусом картофеля (штаммы PVY^O и PVY^NTN). Фолиарное опрыскивание растений водным раствором системина картофеля StPep I, полученного путем твердофазного пептидного синтеза, привело к существенному снижению накопления вируса в зараженных растениях картофеля. Полученные результаты показывают, что синтетический системин картофеля может быть перспективен для разработки в качестве сигнального биостимулятора для повышения устойчивости картофеля к вирусным патогенам. Работа опубликована в журнале Biomolecules.

Ученые из ГНЦ ИБХ РАН и их коллеги изучили природный антимикробный пептид Rip-2 из насекомого Riptortus pedestris, родственный танатину, и показали, что его более выраженная активность по сравнению с танатином может быть связана с наличием C-концевого остатка фенилаланина. Генетический отбор устойчивых клонов E. coli выявил замену R76C в белке LptA – компоненте системы транспорта липополисахарида. Мутагенез пептида, анализ природных гомологов и структурное моделирование позволили предложить проверяемую модель, в соответствии с которой Phe18 пептида Rip-2 участвует во взаимодействии с LptA-зависимой мишенью. Работа уточняет механизм действия танатин-подобных пептидов и может помочь в рациональном дизайне новых антибиотиков. Подробнее

Т-клетки узнают заражённые и опухолевые клетки по молекулярным меткам на их поверхности, и знание того, какой рецептор к какой метке подходит, лежит в основе клеточных терапий рака и вакцин нового поколения. Недавняя независимая проверка подтвердила лишь около половины записей в мировых базах таких соответствий. Учёные из ИБХ РАН и их коллеги показали, как отделить надёжное от ошибочного: предложенный статистический фильтр выделяет ядро записей, которые подтверждаются в эксперименте в 81% случаев против 38% для остальных. Более того, многие «неудачи» оказались ошибкой разметки, а не отсутствием распознавания. Работа опубликована в журнале Nature Methods. Подробнее