Пресс-центр / Дайджест
Синтез нуклеозидов на основе 1,2,4-триазола-3-тиона с использованием пуриннуклеозидфосфорилазы E. coli
Сотрудники отделов биотехнологии и структурной биологии (ИБХ РАН) совместно с коллегами из Института химии растительных веществ (Узбекистан) и Института вирусологии им. Д. И. Ивановского синтезировали серию аналогов нуклеозидов на основе 1,2,4-триазола-3-тиона и исследовали их противовирусную активность в отношении вируса простого герпеса. Производные 1,2,4-триазола обладают широким спектром биологической активности и поиск новых нуклеозидов на их основе является актуальной задачей. Из серии синтезированнных моно- и дизамещённых производных 1,2,4-триазол-3-тиона три соединения оказались субстратами для пуриннуклеозидфосфорилазы E. coli. Для рибозидов и дезоксирибозидов, полученных ферментативным синтезом, было показано, что присоединение углевода у моно- и дизамещённых 1,2,4-триазол-3-тионов происходит по разным атомам азота. Все синтезированные нуклеозиды и гетероциклические основания проверялись на цитотоксичность и активность в отношении вируса простого герпеса первого типа. Индекс селективности двух нуклеозидов оказался значительно выше, чем у противовирусного препарата рибавирина. Также было обнаружено, что с увеличением липофильности исследуемых соединений увеличивается как их активность, так и токсичность. Результаты исследования опубликованы в журнале Biomolecules (IF 4.8). Подробнее
Флуоресцентный сенсор, имитирующий естественную мишень, для обнаружения активности протеазы PLpro и инфекции вирусом SARS-CoV-2 в живых клетках
Папаин-подобная протеаза PLpro играет ключевую роль в жизненном цикле коронавируса SARS-CoV-2, что делает ее перспективной мишенью антивирусной терапии. В данной работе был создан генетически кодируемый флуоресцентный сенсор активности PLpro. Отличительной особенностью сенсора является дизайн, максимально приближенный к природной мишени. Высококонтрастный транслокационный ответ (14-кратное изменение отношения сигнала в ядре и цитоплазме) позволяет надежно детектировать активность PLpro в культурах клеток человека не только в модели сверхэкспрессии рекомбинантной протеазы, но и при заражении вирусом SARS-CoV-2, как было показано сотрудниками Лаборатории генетически кодируемых молекулярных инструментов ИБХ РАН в сотрудничестве с Институтом молекулярной биологии РАН и Центром эпидемиологии и микробиологии им. Гамалеи. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences.
Гликановый состав микровезикул из эндотелиальных клеток
В отличие от экзосом, данные о гликоме микровезикул (МВ) практически отсутствуют. Сотрудники Лаборатории углеводов и Лаборатории молекулярной биофизики ИБХ РАН изучили гликановый состав МВ, полученных из эндотелиальных клеток, с использованием 21 растительного лектина. Полученные результаты показали, что в МВ доминируют олиголактозамины, частично α2-6-сиалилированные в виде N-гликанов. Наиболее ярким отличием МВ от материнских клеток является практически полное отсутствие α2-3-сиалилированных гликанов; показано, что это не результат действия внеклеточных гликозидаз. Кроме того, по сравнению с материнскими клетками, в МВ понижен уровень некоторых Man-содержащих гликанов. Полученные результаты свидетельствуют об избирательности переноса интегральных белков плазматической мембраны в МВ. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular sciences. Подробнее
“Молекулярные портреты” позволили охарактеризовать функциональные состояния ионных каналов TRPV
Ионные каналы TRPV отличаются большим разнообразием функций в клетке, принимая участие в температурной и болевой чувствительности, делении клеток, усвоении кальция и т.д. Ученые из ИБХ РАН и Колумбийского университета проанализировали структуру ключевого домена TRPV – ион-проводящей поры. С помощью оригинального подхода – метода “динамического молекулярного портрета“ - удалось выделить три консервативных состояния поры, общие для всех TRPV: α- закрытое, π-закрытое и π-открытое. Показано, что α-закрытое состояние является наиболее гидрофобным и всегда непроводящим, тогда как π-закрытое менее стабильно и может переходить в открытое состояние с благоприятным для проведения ионов распределением гидрофобности. Работа опубликована в журнале Communications Chemistry. Подробнее
Блокада макрофагов для улучшения доставки наночастиц или бесконечные циклы в наномедицине
Цикл «обнаружить-восхититься-исследовать-разочароваться и забыть» может быть довольно обычной рутиной в исследованиях. Тем не менее в некоторых областях он, кажется, может повторяться много раз. Свежая статья ученых из ИБХ РАН и Университета Бостона анализирует один из таких циклов в области блокады иммунной системы организма наночастицами. Исследование показывает, что прогресс в создании новых наноматериалов наконец может позволить разорвать замкнутый круг и ввести этот метод в клиническую практику для улучшения терапии рака. Работа опубликована в престижном журнале Nature Communications. Подробнее