Институт
биоорганической химии

Транскрипция эукариотических геномов приводит к образованию тысяч длинных некодирующих РНК (длнкРНК), функции большинства которых неизвестны. Хотя длнкРНК не кодируют белков, короткие открытые рамки считывания (кОРС, 100 кодонов), расположенные на них, потенциально могут кодировать микробелки. Используя транскриптомы 479 видов растений, команда ученых из ИБХ РАН, ФНКЦ ФХМ и группы эволюционного анализа (NIH, Бетесда, США) под руководством Евгения Кунина, изучила консервативность и эволюцию кОРС, предсказанных на длнкРНК модельного растения Physcomitrium patens. Было обнаружено, что тысячи эволюционно молодых кОРС находятся под действием отрицательного отбора. Прямое нанопоровое секвенирование РНК показало, что уровень транскрипции консервативных кОРС был значительно выше чем у неконсервативных. Трансляция некоторых из этих кОРС была подтверждена экспериментально. Полученные данные расширяют представления о эволюции этого типа кОРС у растений. Работа опубликована в журнале Nucleic Acids Research.

Трехпетельный секретируемый белок человека SLURP-1 является отрицательным аллостерическим модулятором никотинового ацетилхолинового рецептора α7-типа (α7-nAChR), ответственного за никотин-индуцированную пролиферацию и миграцию клеток рака легкого. Сотрудники Лаборатории биоинженерии нейромодуляторов и нейрорецепторов в коллаборации с учеными из ИБХ РАН и МГУ им. Ломоносова с помощью мультиплексного иммунологического анализа подтвердили вовлечение PI3K/AKT/mTOR сигнального пути в действие этого трехпетельного модулятора, что было предположено в предыдущих работах. Также, методом аффинной хроматографии было показано, что мишенью SLURP-1 в эпителиальных клетках является не только α7-nAChR, но и комплекс α7-nAChR/PDGFR/EGFR. С использованием химерных белков на основе трехпетельного нейротоксина II с пересаженными петлями SLURP-1 было определено, что петля I является основным активным сайтом модулятора ответственным за его антипролиферативный эффект и взаимодействие с α7-nAChR. Работа опубликована в журнале Frontiers Cell and Developmental Biology. Подробнее

Сотрудники ИБХ РАН вместе с коллегами из Лаборатории фотобиологии красноярского Института биофизики (ИБФ СО РАН) определили строение продуктов фотоинактивации хромофора фотопротеина гребневика Beroe abissycola и предложили механизм этого процесса. Впервые показано родство химических трансформаций для хромофоров фотопротеинов и флуоресцентных белков GFP-типа. Результаты опубликованы в журнале Organic Letters. Работа выполнена при поддержке гранта РНФ № 17-14-01169p. Подробнее

Липосомы представляют собой первую и хорошо зарекомендовавшую себя платформу для доставки лекарств с помощью наноразмерных носителей. В организме взаимодействия липосом, как и других наноносителей, опосредуются комплексным динамическим слоем белков плазмы, адсорбированных на поверхности, — белковой короной. В обзоре, подготовленном сотрудниками Лаборатории химии липидов, прослеживается путь от взаимодействий отдельных белков с липидным бислоем до эффектов, опосредуемых короной in vivo. В нем также критически рассмотрены современные методы выделения и анализа белковой короны и предложена классификация подходов к ее использованию на основе соотношения состав липидного бислоя–состав белковой короны–молекулярные взаимодействия–биологические эффекты липосом.

Толл-подобные рецепторы являются ключевыми участниками врожденного иммунитета. Несмотря на большое количество исследований и данных об этих белках, структурно-функциональные основы их работы до сих пор не до конца ясны. Сотрудники лаборатории биомолекулярной ЯМР-спектроскопии, лаборатории биоинформационных методов комбинаторной химии и биологии ИБХ РАН совместно с коллегами из МФТИ и Чанчуньского института прикладной химии (КНР) выявили важную роль цинка в работе толл-подобного рецептора 1 и предложили возможные механизмы цинк-опосредованной активации рецептора. Работа выполнена при поддержке гранта РФФИ 20-­34-­70024 и опубликована в журнале Communications Biology.