Расширение разнообразия pH сенсоров на основе i-мотивов: схема мечения определяет внутриклеточную локализацию
Сотрудники ИБХ с коллегами из ФНКЦ ФХМ им Ю.М. Лопухина разработали pH сенсор на основе i-мотива. Авторы синтезировали новый нефлуоресцентный аналог цитозина tC O Azo , который тушит флуоресценцию известного флуоресцентного миметика цитозина tC O . Включение пары в геномную iM-образующую последовательность C5T привело к созданию высококонтрастного pH сенсора с рабочим диапазоном, совместимым с физиологическими условиями. В отличие от известных сенсоров на основе C5T, которые содержат обычные метки FAM/BHQ или FAM/TAMRA, обеспечивают флуоресцентный сигнал в зеленом/красном каналах и накапливаются в ядрах клеток, предложенный сенсор локализуется преимущественно в цитоплазме и позволяет осуществлять отслеживание pH на основе сигнала tC O в синем канале. Таким образом, авторам удалось преодолеть общую для меченных нуклеиновых кислот (антисмысловые олигонуклеотиды, молекулярные биконы и т.д.) проблему преимущественного накопления в ядрах живых клеток. Работа опубликована в журнале Sensors and Actuators: B. Chemical.
8 апреля 2024 года