Пресс-центр / Дайджест
Функциональное исследование роли белков RPF1 и EFS1 в процессинге пре-рРНК и сборке прерибосомных частиц
Сотрудники Отдела функционирования живых систем ИБХ РАН показали участие ранних (ядрышковых) факторов биогенеза рибосом RPF1 и ESF1 в созревании рибосомных субъединиц. Нокдаун с помощью экспрессии shRNA продемонстрировал уникальное изменение профиля пре-рРНК в ответ на стресс биогенеза рибосом. Дефицит данных белков в клетках человека, в отличие от клеток дрожжей, не является фатальным, что позволяет утверждать о вероятных перестройках процесса для поддержания трансляционной активности клеток. На основании полученных результатов авторы предполагают, что белки RPF1 и ESF1 выполняют структурную функцию и способствуют правильному фолдингу РНК-белковых комплексов для дальнейших стадий процессинга пре-рРНК. Работа опубликована в журнале Cells. Подробнее
Новые Obolenskvirus-подобные фаги Brutus и Scipio: биология, эволюция и взаимодействие фага с хозяином
Сотрудники Лаборатории молекулярной биоинженерии ИБХ РАН совместно с коллегами из других российских институтов выделили и изучили два новых вирулентных фага рода Obolenskvirus, инфицирующих Acinetobacter baumannii, значимый нозокомиальный патоген. Фаги Brutus и Scipio смогли инфицировать штаммы A. baumannii, относящиеся к капсульным типам К116 и К82 соответственно. Авторы Охарактеризовали биологические свойства и геномную организацию фагов, и провели сравнительный геномный, филогенетический и пангеномный анализы. Также было проведено исследование ферментативной активности деполимеразы хвостового шипа, кодируемой в геноме фага Scipio - первого зарегистрированного вируса, инфицирующего A. baumannii капсульного типа К82. Изучение новых представителей рода Obolenskvirus, расширяет знания о разнообразии вирусов внутри этой таксономической группы и стратегиях взаимодействия фагов Obolenskvirus с бактериями-хозяевами. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences.
Осуществлен рациональный дизайн высокоэффективного биокатализатора для фосфорибозилирования противовирусных производных пиразин-2-карбоксамида
Противовирусные препараты T-1105 и T-705 (Фавипиравир) являются неактивными пролекарствами, которые подвергается метаболическому превращению in vivo в активную форму посредством фосфорибозилирования. Эффективность этого процесса в клетках человека крайне низка, что делает актуальной задачу получения фосфорибозилированных производных пиразин-2- карбоксамида in vitro. Сотрудники Отдела биотехнологии ИБХ РАН совместно с коллегами из МГУ и ФНИЦ «Кристаллография и фотоника» РАН создали высокоэффективный биокатализатор на основе гипоксантин-гуанинфосфорибозилтрансферазы из T. thermophilus (TthHGPRT). В результате рационального дизайна активного центра TthHGPRT был получен мутант D106G/Y155W с 325- кратным увеличением скорости синтеза фосфорибозида T-705 и 125-кратным – фосфорибозида T- 1105. Полученные результаты могут послужить основой для создания новых ферментативных технологий получения противовирусных соединений. Работа опубликована в журнале ACS Catalysis. Подробнее
Молекулярный механизм индукции главной оси тела у бесчелюстных позвоночных может отличаться от механизма, описанного у челюстноротых
Для оценки консерватизма индукционного механизма в разных эволюционных линиях позвоночных в Лаборатории молекулярных основ эмбриогенеза были проведены исследования функциональной активности генов Noggin у миноги, как представителя другой, эволюционно наиболее древней группы позвоночных - бесчелюстных. Оказалось, что несмотря на консерватизм функциональных свойств исследуемых генов в экспериментах на амфибиях, у эмбрионов которых гены Noggin миноги способны индуцировать вторичные оси тела, аналогичного эффекта у эмбрионов самой миноги не наблюдается. Эти результаты могут указывать на различия механизмов индукции главной оси тела у челюстноротых и бесчелюстных, что открывает новые перспективы для исследований фундаментальных основ этого процесса. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences. Подробнее
ТБ-ИЗАТЕСТ: способ дифференциальной диагностики Mycobacterium tuberculosis методом LAMP
В работе представлены результаты разработки новой тест- системы ТБ-ИЗАТЕСТ для дифференциальной диагностики Mycobacterium tuberculosis от нетуберкулезных микобактерий по видоспецифичному гену rv2341 с использованием метода петлевой изотермической амплификации (LAMP). Тест- система применима для количественного анализа целевой геномной ДНК и позволяет выявлять десятикратные различия в концентрации. Впервые приводятся результаты оптимизации амплификации с помощью двухстадийного протокола на основе метода ортогональных матриц Тагути. Предложена теоретическая интерпретация высоких значений эффективности амплификации, наблюдаемых в реакции LAMP. Предел детекции разработанной тест-системы составляет 40 геном-эквивалентов на реакцию, а стадия амплификации требует 15 мин. По совокупности характеристик тест-система ТБ-ИЗАТЕСТ превосходит все известные способы идентификации M. tuberculosis методом LAMP. Работа опубликована в журнале Russian Journal of Bioorganic Chemistry. Подробнее