Институт
биоорганической химии

Сотрудниками Лаборатории молекулярной иммунологии в сотрудничестве с коллегами из университетов Тель-Авива (Израиль) и Модены (Италия) показана возможность использования золотых наностержней (размером 50 х 8 нм) для фототермического уничтожения раковых клеток в инфракрасном диапазоне. Инкубация наностержней (GNR) с HER2-специфичным адресным модулем неиммуноглобулиновой природы DARPin приводит к образованию стабильных конъюгатов (DARPin-GNR) способных селективно взаимодействовать с поверхностью HER2-положительных клеток и вызывать их гибель при облучении длиной волны 850 нм. Методами молекулярной динамики установлено, что адресный модуль формирует монослой на поверхности наностержня. При этом домен DARPin, отвечающий за взаимодействие с рецептором HER2, не вовлечен во взаимодействие с наностержнем. Результаты исследования открывают возможность фототерапии опухолей и метастазов глубинных тканей. Работа выполнена при поддержке гранта РНФ № 19-14-00112 и опубликована в журнале ACS Applied Materials Interfaces.

Ученые из Университета Копенгагена, Университета Южной Дании, Мемориального ракового центра им. Слоан Кеттеринг в Нью-Йорке и Беларусского Государственного Университета совместно с сотрудником Лаборатории Биоинформатических Методов Комбинаторной Химии и Биологии ИБХ РАН Ковальчуком С.И. исследовали роль белка PRMT5 в клетке и его онкогенную активность на примере клеток Острой Миелоидной Лейкемии. Было показано, что PRMT5 посредством метилирования регулирует активность белка SRSF1, который в свою очередь отвечает за альтернативный сплайсинг. Подавление PRMT5 приводит к изменениям в альтернативном сплайсинге ряда критически-важных генов и к гибели раковых клеток. На основе полученных данных могут быть разработаны тесты для контроля терапевтического ответа на ингибиторы PRMT5 при лечении раковых заболеваний. Работа опубликована в журнале Nature Structural and Molecular Biology. Подробнее

Группа ученых из Лаборатории молекулярных основ эмбриогенеза ИБХ РАН совместно с коллегами из лаборатории математических методов и моделей в биоинформатике ИППИ РАН разработала биоинформатический метод, позволяющий прицельно находить гены, появившиеся или наоборот исчезнувшие на определенном этапе эволюции. С помощью этого метода был найден ряд генов, исчезнувших у теплокровных животных, в том числе у человека. Для дальнейшего изучения был выбран только один из таких генов, кодирующий неизвестный ранее белок, и на его примере была подтверждена справедливость гипотезы о роли исчезнувших генов в прогрессивном развитии головного мозга и в потере регенерационной способности у теплокровных. При этом, этот трансмембранный белок (c-Answer) является новым модулятором FGF и ADP сигнализации. Результаты опубликованы в журнале Cell Reports. Подробнее

Сотрудники Лаборатории молекулярной токсинологии совместно с учеными Института наук о прикладных материалах Вьетнамской академии наук и технологий показали, что включение дипептида IleTrp (IW) и аденозина (Ado) в наноматериалы существенно повышает их антикоагулятную активность. Ado и IW были включены в термочувствительный наногель, состоящий из гепарина, к которому ковалентно присоединен полимер плюроник P123. При измерении биологической активности in vivo было обнаружено, что инкапсуляция этих соединений в наноматериал значительно усилила их действие, что выражается в увеличении времени кровотечения. Исследование опубликовано в журнале Nanomaterials. Работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований. Подробнее

База данных VDJdb, содержащая последовательности Т-клеточных рецепторов (TCR) с охарактеризованной специфичностью, была создана группой сотрудников отдела Геномики адаптивного иммунитета ИБХ в сотрудничестве с зарубежными коллегами в 2017 году. В недавно опубликованной статье в Nucleic Acid Research авторы представили обновленную версию, включающую два дополнительных режима анализа данных. Обновленная версия содержит более 60 000 последовательностей TCR человека, мыши и других позвоночных, для которых показана специфичность к более чем 200 эпитопам из белков различных патогенов и селф-антигенов. Обновление также включает несколько дополнительных способов анализа. Внесенные дополнения и расширение объема VDJdb существенно повышает эффективность использования этого инструмента при исследовании системы адаптивного иммунитета. Подробнее