Пресс-центр / Дайджест
Примембранный цитоплазматический регион толл-подобных рецепторов оказался функционально-значимым элементом трехмерной структуры белков
Толл-подобные рецепторы – ключевые участники врожденного иммунного ответа. Основываясь на данных ЯМР-спектроскопии, молекулярного моделирования и функциональных исследований, командой Лаборатории биомолекулярной ЯМР-спектроскопии совместно с коллегами из Лаборатории моделирования биомолекулярных систем, Лаборатории биосинтеза низкомолекулярных физиологически активных соединений и Чанчуньского института прикладной химии были получены структуры трансмембранных и примембранных регионов, а также показана их функциональная значимость при активации рецепторов. Результаты работы опубликованы в журнале Nature Communication. Подробнее
Многослойные полиэлектролитные капсулы, загруженные доксорубицином и модифицированные противоопухолевым DR5-специфичным вариантом TRAIL
Носители, обеспечивающие активную направленную (таргетную) доставку противораковых препаратов в опухолевые клетки, являются перспективными для химиотерапии рака. Сотрудники ИБХ РАН совместно с коллегами из других российских институтов разработали биоразлагаемые полиэлектролитные микрокапсулы, которые были модифицированы лигандом DR5-B. Последний является перспективным рекомбинантным аналогом цитокина TRAIL (tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand), который специфически связывается с рецептором смерти DR5, гиперэкспрессированным на поверхности опухолевых (но не нормальных) клеток. Созданные капсулы были также загружены противораковым препаратом доксорубицином (DOX). Было продемонстрировано, что использование таких капсул обеспечивало как таргетную доставку лекарства в опухолевые клетки, так и синергический противораковый эффект. Работа опубликована в журнале Nanomaterials. Подробнее
Различие структурно-динамических свойств и взаимодействий с липидным окружением объясняет особую функциональную роль трансмембранных доменов в подсемействе рецепторов инсулина
Рецепторные тирозинкиназы InsR, IGF1R и IRR подсемейства рецепторов инсулина играют важную роль в межклеточных сигнальных путях различных физиологических процессов. Имея высокую гомологию последовательности и структуры, рецепторы не схожи по своей локализации, экспрессии и функциям в организме человека. Команда ученых из ИБХ РАН в сотрудничестве с коллегами из других институтов с помощью ЯМР-спектроскопии высокого разрешения и компьютерного моделирования установила, что конформационная изменчивость трансмембранных доменов и их взаимодействие с окружающими липидами существенно различаются у представителей подсемейства. Таким образом, в разнообразных механизмах активации InsR, IGF1R и IRR следует учитывать гетерогенное мембранное окружение. Механизм мембрано-опосредованного контроля передачи сигналов рецепторами открывает новые перспективы для разработки таргетных методов лечения заболеваний, связанных с дисфункцией данных рецепторов. Результаты опубликованы в журнале International Journal of Molecular Sciences. Подробнее
Флуоресцентная система на основе аптамера Манго позволяет отслеживать малую некодирующую РНК бактерий в инфицированных макрофагах
Сотрудники ИБХ РАН с коллегами из ФНКЦ физико-химической медицины и других российских институтов разработали платформу для флуоресцентной визуализации малых некодирующих РНК (мнРНК) в живых клетках. Система состоит из флуорогенного цианинового красителя и генетически кодируемой метки на основе аптамера Манго II, которая присоединяется к исследуемой мнРНК и вызывает усиление флуоресценции при связывании с красителем. В работе предложен подход к оптимизации спектральных свойств красителей и разработана минимальная генетически кодируемая метка (52 но) для визуализации мнРНК. Применимость разработанной платформы продемонстрирована на примере визуализации мнРНК Mycobacterium tuberculosis в бактериях и инфицированных бактериями макрофагах. Работа опубликована в журнале Nucleic Acids Research.
Оценка неоднородности структуры поверхности наночастиц ядро-оболочка с помощью изменения контраста МУРР и моделирования ab initio
Группа ученых из Лаборатории молекулярной биофизики и Лаборатории углеводов ИБХ РАН, в сотрудничестве с коллегами из Института кристаллографии имени А.В. Шубникова РАН и Европейской молекулярно-биологической лаборатории в Гамбурге, разработали новый подход для исследования структуры наночастиц. В их работе, опубликованной в журнале Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, использовали методы контрастирования МУРР и молекулярной динамики для описания структуры поверхности наночастиц ядро-оболочка, образованных амфифилом biotin-CMG2-DOPE. Подход выявляет неоднородность поверхности наночастиц в неравномерном распределении полярного спейсера CMG2 вокруг неполярного ядра и его локализации в виде «островов». Проведенное сравнение результатов с полноатомной структурой наночастиц, полученной при моделировании молекулярной динамики, показало хорошее согласование их между собой, подтвердив эффективность нового подхода для исследования структуры наночастиц. Подробнее