Институт
биоорганической химии

Сотрудникам ИБХ РАН вместе с зарубежными коллегами удалось обнаружить ранее неизвестную эволюционную зависимость между эффективностью стартовых кодонов и встречаемостью AUG кодонов в 5'-концевой части белок-кодирующих последовательностей. В том случае, когда старт кодоны мало эффективны, вероятность встречаемости следующего АUG кодона выше в той же рамке считывания. В то время как для высоко-эффективных кодонов встречаемость следующего АUG кодона выше в альтернативных рамках. Им также удалось показать  что слабая инициация на первом старт кодоне связана с синтезом укороченных протеоформ обусловленных инициацией на втором старте. Работа опубликована в журнале Genome Research. Подробнее

Коллаборация ученых из Института биоорганической химии им. М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН, Московского физико-технического института и Института общей физики им. А. М. Прохорова РАН разработала революционную технологию, которая решает ключевую проблему, десятилетиями препятствовавшую внедрению в клиническую практику новейших лекарств. Предложенная технология позволяет значительно увеличить время циркуляции в крови практически любых биомедицинских наноматериалов, повышая таким образом их терапевтическую эффективность. Работа российского коллектива опубликована в одном из самых авторитетных научных журналов в области биомедицины — Nature Biomedical Engineering. Кроме того, статья отмечена отдельным новостным обзором (News and Views) журнала. Подробнее

Исследователи из Лаборатории биокатализа ИБХ РАН открыли фермент – киназу, обеспечивающую резистентность по отношению к антибиотику амикумацину. AmiN является представителем нового подсемейства киназ, специфично инактивирующих изокумариновые антибиотики. Уникальность данной киназы заключается в ее необычайно высоком сродстве к субстрату, позволяющему высокоэффективно элиминировать даже следовые количества антибиотика в диапазоне наномолярных концентраций. Комплекс методов, включающих рентгеноструктурный анализ и математическое моделирование, позволил детально исследовать совершенный механизм катализа, связанный с закрытием активного центра фермента. Результаты, опубликованные в журнале Science Advances, не только расширяют фундаментальные знания в области энзимологии, но и позволяют предсказывать наличие антибиотикорезистентности на геномном уровне. Подробнее

Формирование древесины крайне сложный процесс, которым управляют более чем 40000 генов. На клеточном уровне, древесина это лигнифицированные клеточные стенки в состав которых входят целлюлоза, гемицеллюлоза и лигнины. Основным компонентом гемицеллюлозы являются ксилоглюканы, они формируют короткие сшивки между целлюлозными нитями, снижающие эластичность клеточной стенки. Ученые из Группы лесной биотехнологии ИБХ РАН совместно с коллегами предположили, что частичный, а не избыточный, гидролиз ксилоглюканов может повлиять на эластичность клеточной стенки, а косвенно на скорость роста дерева. На трансгенных моделях осины было показано, что суперэкспрессия рекомбинантной ксилоглюканазы из гриба P.canescens приводит не только к гидролизу ксилоглюканов клеточной стенки, но и сопровождается изменениями в фенотипе, включающими ускорение роста, изменение углеводного состава древесины и замедление темпов её разложения. Работа опубликована в BMC Plant Biology. Подробнее

Сотрудники Лаборатории биомолекулярной ЯМР-спектроскопии ИБХ РАН совместно с коллегами из Чаньчуньского института прикладной химии (КНР) исследовали олигомеризацию ключевого онкогена Вируса Эпштейна-Барр - белка LMP1. На основе метода ЯМР была разработана уникальная методика, позволяющая определять олигомерные состояния 5-ой трансмембранной спирали LMP1 в различных условиях. С использованием молекулярного моделирования это позволило расшифровать механизм действия потенциального лекарства пентамидина. Представленная методика открывает новые возможности для изучения лекарств, направленных на трансмембранные домены белков. Работа выполнена при поддержке Российского Научного Фонда и опубликована в журнале BBA Biomembranes.