Пресс-центр / Дайджест
Новые структурные данные позволили изучить механизм ингибирования онкоканала TRPV6 природным фитоэстрогеном генистеин
Ca2+ - Селективный ионный канал TRPV6 является ключевым участником клеточной пролиферации, его избыточная экспрессия наблюдается при самых тяжелых видах рака у человека. Несмотря на свою фармакологическую ценность, блокаторы TRPV6 природного происхождения до сих пор не изучали. Сотрудники Лаборатории моделирования биомолекулярных систем ИБХ РАН совместно с коллегами из Колумбийского университета (Нью-Йорк, США) выявили структурные аспекты взаимодействия TRPV6 с природным фитоэстрогеном генистеин, который ранее показал себя в клинических исследованиях как блокатор клеточной инвазии и метастазирования. Путем совместного применения экспериментальных и вычислительных методов показано, что генистеин, связываясь с TRPV6, работает как поровый блокатор, изменяющий структуру активационных ворот канала. Описанный молекулярный механизм открывает новые возможности в разработке противораковых препаратов. Работа опубликована в журнале Nature Communications. Подробнее
Структура белка AstaP объясняет его способность связывать широкий набор каротиноидов
AstaP – группа каротиноид-связывающих белков, обнаруженных в микроводорослях. "Ядро" белка AstaP составляет домен FAS1, широко распространенный в различных организмах, от бактерий до человека. Ранее этот домен был описан только для белков клеточной адгезии. AstaPo1 – первый белок, для которого была обнаружена новая функция, которую может выполнять FAS1 домен: связывание каротиноидов. Сотрудники Лаборатории биомолекулярной ЯМР-спектроскопии ИБХ РАН и группы "Белок-белковые взаимодействия" ФИЦ Биотехнологии РАН исследовали пространственную структуру AstaPo1 и её связь с функцией белка. Результаты работы опубликованы в журнале Communications biology. Подробнее
Идентификация проксимального интерактома основного белка миелина с использованием метода TurboID
Использование метода TurboID с последующими масс-спектрометрической идентификацией и биоинформатической обработкой в присутствии двойных контролей позволяет с высокой точностью определить белковое окружение неструктурированных белков, подобных основному белку миелина (МВР). Ученые из Лаборатории белков гормональной регуляции ИБХ РАН и МФТИ идентифицировали интерактом МВР, слитого с TurboID – генно-инженерной биотинлигазой, которая ковалентно присоединяет биотин к близлежащим белкам. Было показано, что МВР взаимодействует с белками адгезии и везикулярного транспорта, а также вовлеченными в метаболизм липидов и железа. Принимая во внимание возрастающую роль ферроптоза и везикулярного транспорта в развитии аутоиммунной нейродегенерации, MBP может рекрутировать эти факторы и регулировать активность вышеуказанных процессов, тем самым централизуя свою роль в поддержании целостности миелиновой оболочки. Работа опубликована в журнале Cells.
Ферментативный синтез 2-хлорпуриновых арабинонуклеозидов с амидами хиральных аминокислот в положении С6 и оценка их антипролиферативной активности in vitro
Команда ученых из Отдела биотехнологии ИБХ РАН синтезировала серию пуриновых арабинозидов, содержащих хлор в положении С2 и амиды хиральных аминокислот в положении С6 пурина. Новый ряд нуклеозидов получали с использованием реакции трансгликозилирования осуществляемой рекомбинантными нуклеозидфосфорилазами E. coli. В синтезе использовали параллельный процесс арсенолиза рибозидов для смещения равновесия реакции в сторону образования арабинонуклеозидов. Синтезированные нуклеозиды устойчивы к действию аденозиндезаминазы E. coli. Коллегами из РОНЦ им. Н.Н. Блохина (Москва, Россия) было проведено исследование антипролиферативной активности синтезированных нуклеозидов на клеточной линии острого миелоидного лейкоза человека U937. Среди серии соединений производное серина проявляло уровень активности (IC50 = 16 мкМ) близкий к активности неларабина (IC50 = 3 мкМ), и оценивалось как активное. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences. Подробнее
Цитотоксические конъюгаты антитело-лекарство, нацеленные на опухоль- ассоциированный антиген PRAME
Конъюгаты антитело-лекарство (antibody-drug conjugates, ADC) являются перспективным средством терапии онкологических заболеваний. Сотрудники Лаборатории молекулярного дизайна и синтеза совместно с коллегами из Лаборатории молекулярной диагностики и Лаборатории химии липидов ИБХ РАН, а также НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина, разработали ряд подходов к синтезу конъюгатов антител к опухоль-ассоциированному антигену PRAME с противоопухолевыми препаратами доксорубицином и ауристатином (ММАЕ). Сайт- специфическая конъюгация была осуществлена путём периодатного окисления гликанов с последующими биоортогональными реакциями – оксимным лигированием и CuAAC. Для простоты определения стехиометрии конъюгатов в структуру линкеров были введены цианиновые красители. В результате работы впервые показана возможность создания конъюгатов антитело-лекарство, нацеленных на антиген PRAME. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences.