Пресс-центр / Дайджест
Исследования вариабельности числа копий фрагментов ДНК по данным высокопроизводительного секвенирования
Традиционно для детекции хромосомных аномалий применяют цитогенетические и молекулярно-цитогенетические методы. С развитием технологий секвенирования стали доступны новые подходы, позволяющие идентифицировать структурные вариации размером от 50 пн. Сотрудники Лаборатории молекулярной онкологии ИБХ РАН совместно с коллегами из ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России разработали подход для формирования валидационного набора на уровне экзонов и оценили эффективность алгоритмов, предназначенных для данных полноэкзомного секвенирования. Работы опубликованы в журналах Scientific Reports и International Journal of Molecular Sciences. Подробнее
7,8-дигидро-8-оксо-1,N6-этеноаденин: миметик тимина, спаривающийся исключительно Хугстиновской стороной в ДНК, который вызывает трансверсии A → T в Escherichia coli
Сотрудники Группы молекулярных инструментов для исследования живых систем и Лаборатории молекулярной диагностики ИБХ РАН с коллегами из Сколтеха, ФНКЦ физико-химической медицины, Массачусетского технологического института (США) и института химической физики «Рокасолано» (Испания) разработали ДНК модификацию, 7,8-дигидро-8-оксо-1,N6-этеноаденин (оксо-ϵA), не встречающееся в природе синтетическое основание, сочетающее в себе структурные особенности двух природных повреждений ДНК (7,8-дигидро-8-оксоаденин и 1,N6-этеноаденин). Способность оксо-ϵA имитировать природное основание тимин и регулировать стабильность дуплексов, а также ее сильная флуоресценция и невидимость для ферментативных систем репарации in vivo являются свойствами, которые могут найти применение в разработке молекулярных инструментов и терапевтических средств на основе нуклеиновых кислот. Работа опубликована в журнале Nucleic Acids Research.
Определены возможные механизмы действия силиконовых и золотых наночастиц на дифференцировку стволовых клеток
Сотрудники Лаборатории клеточных взаимодействий, Отдела биоматериалов и бионанотехнологий и Учебно-научного центра с коллегами из МИФИ и Центра матери и ребенка им. Кулакова провели анализ механизмов стимуляции остеогенной и подавления адипогенной дифференцировки стволовых клеток под действием силиконовых и золотых наночастиц. Авторы выявили два основных механизма действия наночастиц: стимуляцию экспрессии CD13 и CD90 и влияние на уровень G-CSF и VEGF в процессе остеогенной дифференцировки МСК. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Science.
Разработан метод выявления опухолей по анализу плазмы крови
Сотрудники Отдела геномики адаптивного иммунитета ИБХ РАН с коллегами из РНИМУ им. Н.И.Пирогова, НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина и ФЦМН ФМБА разработали метод обнаружения опухолей в организме человека по особенностям структуры концов фрагментов свободно циркулирующей ДНК крови (сцДНК). Исследователи изучили концевые участки сцДНК в определённых регионах генома с высоким разрешением, и на основе их последовательностей и положения в геноме смогли различить образцы крови, полученные от здоровых и больных доноров в группе из 175 человек. Разработанный метод профилирования концов сцДНК позволяет обнаружить колоректальный рак и рак почки по образцу плазмы крови уже на ранних стадиях заболевания. Работа опубликована в журнале Molecular Cancer.
Фосфолипазы А2 из ядов змей ингибируют репликацию ВИЧ
С начала эпидемии ВИЧ, длящейся более 30 лет, основной целью ученых была разработка эффективных методов профилактики и лечения ВИЧ-инфекции, в том числе и поиск новых соединений, обладающих высокой активностью против ВИЧ. Исследования, проведенные сотрудниками Отдела молекулярной нейроиммунной сигнализации ИБХ РАН и НИЦЭМ им. Н.Ф.Гамалеи, показали, что фосфолипазы А2 (PLA2) из змеиного яда обладают выраженным анти-ВИЧ эффектом. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences. Подробнее