Одним из наиболее универсальных показателей состояния системы адаптивного иммунитета организма является количественная и функциональная вариабельность клонального состава периферических Т- и В-лимфоцитов – индивидуальный репертуар Т-(В-)клеточных рецепторов (TCR и BCR). Начальной целью проекта РНФ-15-15-00178 было определение динамики репертуара TCR в ходе иммунного ответа организма человека на некоторые патогенны рода Flavivirus, а именно – при вакцинации живой аттенуированной вакциной YF-17D против вируса желтой лихорадки и культуральной очищенной инактивированной "Вакциной клещевого энцефалита". А методологической основой проекта является глубокий анализ полного репертуара периферических лимфоцитов, реконструируемый по результатам массированного секвенирования кДНК генов TRB/TRA Т-клеточных рецепторов человека. В результате выполнения предшествующего этапа Проекта нами (i) Реконструированы и охарактеризованы индивидуальные репертуары периферических Т-лимфоцитов всей когорты вакцинируемых доноров для серии показательных временных точек 18-месячного периода обследования. (ii) Определена динамика изменений индивидуальных репертуаров Т-клеточных клонов у индивидов, вакцинированных разными типами вакцин и (iii) Выявлены обширные группы клонов Т-клеток, представляющие индивидуальные субпопуляций вакцин-ассоциированных Т-лимфоцитов. Расшифровка молекулярных и клеточных механизмов формирования иммунного ответа организма человека на вирусную инфекцию и/или противовирусную вакцинацию продолжает оставаться одной из центральных проблем фундаментальной и клинической иммунологии. Актуальность решения проблемы, применительно к эффективной защите населения от флавивирусных инфекций, подчеркивается в ряде обзоров, обобщающих опыт международных консорциумов по использованию вакцин от вируса желтой лихорадки (YFV) и вируса клещевого энцефалита (TBEV). В целом ряде исследований последних лет было продемонстрировано, что ключевой характеристикой первоначальной реакции системы адаптивного иммунитета на обе вакцины является формирование специализированных субпопуляций Т-клеток. Вместе с тем, характеристика как фенотипического, так и функционального или клонального своеобразия таких субпопуляций требует дальнейшего исследования. Основной целью данного этапа Проекта будет комплексная характеристика фенотипических и структурно-функциональных свойств групп Т-клеточных клонов, ассоциированных с развитием иммунного ответа на вакцины против вирусов желтой лихорадки и клещевого энцефалита у расширенной выборки здоровых доноров включающей несколько пар монозиготных близнецов и неродственных индивидов различного возраста. Успешная реализация проекта позволит получить уникальный массив новых данных, существенным образом углубляющих современные представления о молекулярных и клеточных механизмах реформирования системы адаптивного иммунитета человека в ответ на флавивирусное заражение. Приоритетные результаты могут быть получены по следующих основным направлениям: - определение динамики общего репертуара периферических Т-лимфоцитов, репертуаров антиген-специфичных Т-клеток и клеток памяти при вакцинации против вирусов желтой лихорадки и клещевого энцефалита; - характеристика функциональных свойств и определение особенностей транскриптома для субпопуляций и клонов Т-клеток, формирующихся при развитии антифлавивирусной защиты организма человека; - определение вклада генетических факторов в вариабельность и специфичность Т-клеточного иммунного ответа на YF-17D вакцину и ВКЭ вакцину.