Клональная архитектура лейкемических клеток и их эволюция при гемобластозах у детей
Острый лимфобластный лейкоз (ОЛЛ) является самым частым онкологическим заболеванием у детей. Согласно современным представлениям, развитие лейкоза происходит из лимфоидных клеток-предшественников, которые, накапливая мутации, трансформируются в лейкемические клетки, поражающие костный мозг пациента и впоследствии другие органы. В зависимости от индивидуальных особенностей прогрессии ОЛЛ в костном мозге может формироваться как единственный лейкемический клон, так и несколько субклонов. Изначальная клональная гетерогенность может являться одним из ключевых факторов, обеспечивающих выживание лейкемических клеток в ходе терапии, приводя в конечном счете к развитию рецидивов. Основной целью проекта является комплексное изучение особенностей формирования клонального разнообразия и эволюции лейкемических клеток при В- и Т-линейном остром лимфобластном лейкозе у детей. В ходе реализации проекта будет разработан высокопроизводительный мультиплексный метод, позволяющих с беспрецедентно низкими затратами реконструировать клональную архитектуру лейкемических клеток одновременно для сотен пациентов. С помощью разработанного метода будут впервые проведен масштабный комплексный анализ клональных структур детских Т- и В-ОЛЛ на уровне единичных клеток. Для анализа клональной архитектуры лейкозов будут впервые одновременно анализироваться геномные перестройки всех существующих генов Т- и В-клеточных рецепторов, включая ранее не анализируемые локусы TRA, что позволит получить прежде недоступную точность при определении клональных структур лейкемических клеток. Кроме того, в ходе анализа транскриптомов лейкемических клеток будет осуществлен поиск генетические факторов, лежащих в основе формирования клонального разнообразия ОЛЛ.
1 Июля 2020 года 30 Июня 2023 года
Список публикаций по проекту
- (2022). Lineage Conversion in Pediatric B-Cell Precursor Acute Leukemia under Blinatumomab Therapy. Int J Mol Sci 23 (7),
- (2022). Epigenetic regulator genes direct lineage switching in MLL/AF4 leukaemia. Blood 140 (17), 1875–1890
- (2022). Reliable Flow-Cytometric Approach for Minimal Residual Disease Monitoring in Patients with B-Cell Precursor Acute Lymphoblastic Leukemia after CD19-Targeted Therapy. Cancers (Basel) 14 (21),
- (2023). The use of non-functional clonotypes as a natural calibrator for quantitative bias correction in adaptive immune receptor repertoire profiling. Elife 12,
- (2023). Novel bimodal TRBD1-TRBD2 rearrangements with dual or absent D-region contribute to TRB V-(D)-J combinatorial diversity. Front Immunol 14, 1245175