Основные направления исследований группы включают:

• дизайн и синтез нуклеотидных модификаций для регулирования свойств канонических и неканонических вторичных структур нуклеиновых кислот; 
• разработку нуклеотидных модификаций, пригодных в антисенс- и RNAi технологиях;
• синтез и скрининг зондов/лигандов для детекции и изменения физико-химических параметров неканонических вторичных структур нуклеиновых кислот;
• разработку и исследование свойств олигонуклеотидных модификаций, связывающихся с ионами металлов;
• исследование физико-химических свойств модификаций, возникающих в живых организмах под воздействием мутагенных факторов окружающей среды;
• дизайн и синтез противовирусных соединений.

Неканонические структуры ДНК широко применяются для регуляции экспрессии генов, в ДНК нанотехнологии и в разработке сенсоров на основе ДНК. В частности, особое внимание в последнее время уделяется I-мотивам, которые представляют собой два интеркалированных параллельных дуплекса, удерживаемых вместе за счет образования гемипротонированных пар цитозин-цитозин. Поскольку образование данных пар и, соответственно, i-мотивов происходит в достаточно узком диапазоне pH (3.0-6.5), существует необходимость в инструментах, позволяющих осуществлять «тонкую настройку» свойств данных неканонических структур.

Мы осуществили рациональный дизайн новой замещенной феноксазиновой модификации и исследовали ее свойства в составе модельных и геномных последовательностей, способных образовывать i-мотивы. Было показано, что включение данной модификации обеспечивает значительную термическую стабилизацию и также позволяет изменять значение pH перехода, представляющего собой важный параметр, например, при дизайне pH сенсоров и зондов для детекции низкомолекулярных лигандов, катионов и белков. Результаты исследования опубликованы в журнале Nucleic Acids Research (10.1093/nar/gky121).

Научные проекты

Загрузка...

Аралов Андрей Владимирович

Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10 — На карте