Пресс-центр / новости / Наука /
Профаговые области в куртобактериальных геномах: мал золотник, да дорог
Curtobacterium — род грамположительных бактерий порядка Actinomycetales. Некоторые виды Curtobacterium являются патогенами сельскохозяйственных культур, таких как соя, сухие бобы, горох, сахарная свекла и столовая свекла, которые встречаются во всем мире. Около 200 геномов видов Curtobacterium, включая метагеномные последовательности, были проверены на наличие последовательностей возможного профагового происхождения.
Один из предсказанных умеренных фагов был индуцирован из генома Curtobacterium. Биоинформатический анализ смоделированных белков, кодируемых в областях, происходящих от профагов, привел к обнаружению около 100 ферментов, разрушающих гликополимеры. Эти белки могут быть рассмотрены для экспериментального дизайна новых антибактериальных средств против фитопатогенов Curtobacterium.
Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences.
Рисунок 1. Генетические карты некоторых предполагаемых профагов, содержащихся в геномах
Curtobacterium. Стрелки указывают направление транскрипции.
Рисунок 2. Электронная микрофотография изображение фаговой частицы, индуцированной митомицином
С, из бактериальной культуры Curtobacterium sp. VKM Ас-2884. Размер шкалы составляет 50 нм.
Рисунок 3. Филогенетическое дерево, основанное на аминокислотных последовательностях ферментов,
разрушающих гликополимер, с использованием структурного сходства, оцененного с помощью
TM-score.
23 января 2023 года