Реакции переноса протонов в мутантах по донорному сайту ESR, ретинального белка Exiguobacterium sibiricum
Микробные родопсины – интегральные мембранные белки, содержащие хромофор ретиналь и осуществляющие светозависимый транспорт ионов или другие функции. Интерес к ним во многом объясняется перспективами использования в оптогенетике с целью регуляции активности нейронов, в том числе для терапии различных заболеваний. Объектом исследований коллектива ученых из Лаборатории инженерии белка и Группы нанобиоинженерии ИБХ РАН является родопсин Exiguobacterium sibiricum (ESR). Наличие остатка лизина в положении 96, соответствующем внутрибелковому донору протонов для основания Шиффа, отличает его от бактериородопсина (БР), наиболее изученного ретинального белка. В новой работе, выполненной с участием коллег из других российских и зарубежных институтов, авторы показали, что остатки Asp или Glu в этом положении эффективно выполняют в молекуле ESR функцию донора. Однако кинетики фотоцикла и переноса зарядов в мутантах существенно отличаются от БР, что указывает на альтернативный механизм репротонирования основания Шиффа в ESR. Работа опубликована в журнале J Photochem Photobiol B.
12 августа 2022 года