20-015-00462

Фенотипические особенности детских В-клеточных лейкозов с геномными перестройками локуса альфа цепей Т-клеточного рецептора

Болезни онкологического профиля, в том числе злокачественные заболевания кроветворной системы, по-прежнему занимают одно из лидирующих мест по частоте среди социально-значимых заболеваний как в России, так и во всем мире. В этом контексте острые лимфобластные лейкозы (ОЛЛ) занимают особое место, относясь к тем немногим онкологическим заболеваниям уровень успешного лечения которых достиг рекордных 85-90%. Наблюдаемые успехи в лечении лейкозов прежде всего связаны с переходом на риск-ориентированные стратегии лечения и применение высокодозной полихимиотерапии. В настоящее время основной причиной смертности при ОЛЛ являются рефрактерные формы лейкозов и рецидивы, одной из причин которых является клональная эволюция и изначально высокое клональное разнообразие лейкемических клеток. Одним из наиболее надежных методов выявления клональности лейкемических клеток при ОЛЛ является массированное секвенирование перестроек генов Т- и В-клеточных рецепторов. В большинстве B-клеточных ОЛЛ кроме перестроек собственно В-клеточных рецепторов наблюдается аномалия – присутствие перестроек Т-клеточных рецепторов. Предполагается, что такие перестройки формируются сразу после лейкемического перерождения В-лимфобластов и характерны для лейкемических субклонов, в то время как перестройки В-клеточных рецепторов свойственны для доминирующих клонов. Данное исследование направлено на изучение особенностей формирования клональной структуры В-линейных ОЛЛ у детей и влияния на этот процесс аномальных для В-клеток перестроек генов альфа цепей Т-клеточных рецепторов. В ходе исследования будут выявлены ранее неизученные при В-ОЛЛ перестройки генов альфа цепей Т-клеточных рецепторов, определена частота их встречаемости как в дебюте, так и при рецидиве ОЛЛ и определены характерные фенотипические особенности лейкемических клонов, содержащих такие аномальные перестройки. Полученные в ходе исследования фундаментальные знания в значительной степени обогатят существующие представления о влиянии клонального разнообразия лейкемических клеток на прогрессию лейкоза и лягут в основу создания новых диагностических подходов для выявления риска развития рецидивов при ОЛЛ у детей.

6 Января 2020 года — 31 Декабря 2022 года

Комков А.Ю. (рук.)

Лаборатория сравнительной и функциональной геномики

Грант, РФФИ

Список публикаций по проекту

  1. Smirnova AO, Miroshnichenkova AM, Olshanskaya YV, Maschan MA, Lebedev YB, Chudakov DM, Mamedov IZ, Komkov A (2023). The use of non-functional clonotypes as a natural calibrator for quantitative bias correction in adaptive immune receptor repertoire profiling. Elife 12,