Пресс-центр / новости / Наука /
Создан генетически кодируемый флуоресцентный сенсор для измерения рН внеклеточной среды
Определение значения рН в живых клетках и тканях имеет большое значение в физиологии и клеточной биологии. Сотрудники ИБХ РАН из Лаборатории клеточной биологии рецепторов, Лаборатории молекулярной тераностики и Группы молекулярной физиологии совместно с коллегами из ИОФ им. А.М. Прохорова и МГУ имени М.В. Ломоносова создали генетически кодируемый флуоресцентный сенсор для измерения рН внеклеточной среды в слабощелочном диапазоне.
Для реализации этой задачи этого был получен ряд химерных белков, представляющих собой описанный ранее рН сенсор SypHer3s с различными трансмембранными доменами: от CIRL2, ErBb2, TrkA, IR и нейрексина-1. Среди этих белков слияния только вариант с трансмембранным доменом нейрексина-1 оказался локализованным на клеточной мембране. Данный белок был назван SypHerExtra. Было показано, что при возбуждении на 445 нм время жизни флуоресценции как SypHer3s, так и SypHerExtra зависит от значения рН. С помощью метода конфокальной микроскопии с временным разрешением (fluorescence lifetime imaging microscopy,FLIM) на живых опухолевых клетках было продемонстрировано, что SypHerExtra можно успешно использовать для определения внеклеточного рН, в то время как SypHer3s можно применять для измерения внутриклеточного рН. Таким образом, эти два сенсора подходят для количественных измерений внутриклеточного и внеклеточного рН в диапазоне от 7,5 до 9,5 в различных биологических системах с использованием метода FLIM.
Результаты данной работы опубликованы в журнале Biosensors.
14 декабря 2021 года