Селективность DHHC-ацилтрансфераз в отношении жирных кислот определяется геометрическими особенностями фермента
Ученые из Группы анализа структуры мембранных белков in silico и Лаборатории моделирования биомолекулярных систем ИБХ РАН в коллаборации с коллегами из других российских и зарубежных институтов предсказали молекулярную основу селективности ферментов семейства DHHC ацилтрансфераз человека (hDHHC) по отношению к жирным кислотам. Анализ большого набора траекторий молекулярной динамики показал, что селективность hDHHC20 по отношению к пальмитоилу (C16) определяется вигвамо-подобной формой фермента: в середине трансмембранного сегмента имеется узкое место, которое регулирует позиционирование реагирующих групп обеих молекул. На основании этой гипотезы был предсказан мутант hDHHC20 V185G с доказанным in silico сдвигом селективности в сторону C18. Работа опубликована в International Journal of Molecular Sciences.
6 июня 2022 года