Разработка средств профилактики и лечения COVID-19 и сопутствующих инфекционных заболеваний с использованием генетических технологий
Целью проекта является обеспечение глобального лидерства, а также решение принципиально новых фундаментальных и крупных прикладных задач мирового уровня, направленных на создание ведущих мировых исследовательских коллективов в области генетических технологий.
Для реализации глобальной цели Исследовательской программы будут осуществлены экспериментальные исследования по трем взаимосвязанным и взаимопересекающимся направлениям.
- Генетическая предрасположенность.
- Разработка технологий анализа генетической предрасположенности популяций РФ на основе дифференциального биоинформатического и протеомного анализа главного комплекса гистосовместимости ГКГС/пептиды когорт пациентов, переболевших COVID-19 и устойчивых к заболеванию.
- Профилактика.
- Разработка платформы создания и тестирования отечественных мРНК-вакцин для профилактики вирусных инфекций с использованием генетических технологий, на примере COVID-19.
- Лечение.
- Разработка скрининговой экспресс-технологии для поиска нейтрализующих антител против вирусных заболеваний, на примере COVID-19.
- Разработка иммунобиологических лекарственных препаратов на основе вирус нейтрализующих антител с различными вариантами константных доменов для различных режимов доставки препарата в организм (инъекции, ингаляции).
- Разработка модульных иммунобиологических средств на основе таргетного пептида или фрагментов антител и специфической РНКазы (барназы) для терапии инфекций, вызванных РНК-содержащими вирусами, на примере COVID-19.
- Разработка универсальной скрининговой микрофлюидной технологии для поиска антибиотических соединений против возбудителей сопутствующих инфекционных заболеваний при COVID-19.
- Поиск новых антибиотиков на основе антимикробных пептидов их модифицированных аналогов для лечения заболеваний, вызванных антибиотикорезистентными нозокомиальными инфекциями.
- Разработка противовирусных лекарственных средств на основе малых молекул: ингибиторов рибосомы, ингибиторов вирусных протеаз и нуклеозидов.
В рамках Проекта опубликованы геномы:
- XM14 - Streptococcus sp. X1
- XM11 - Staphylococcus sp.
- XM1 - Bacillus sp.
- PSM14 - Pseudomonas sp.
- PM15 - Bacillus sp.
- PM12 - Bacillus sp.
- MM3 - Leuconostoc sp.
- EM3 - Bacillus sp.
- EM1 - Bacillus sp.
- DM - Acinetobacter sp.
- X27 - Streptococcus dysgalactiae
- X1 - Bacillus cereus
- Ps1 - Pseudomonas aeruginosa
- P1 - Bacillus pumilus
- M31 - Leuconostoc garlicum
- E32 - Bacillus amyloliquefaciens
- E18 - Staphylococcus pseudintermedis
- E14 - Bacillus pumilus
- D10 - Bacillus pumilus
- D1 - Acinetobacter radioresistens
- Actinomadura sp. A-12
- Actinomadura sp. A-23
- Actinomadura sp. A-34
- Actinomadura sp. A-39
- Actinomadura sp. A-4
- Actinomadura sp. A-48
- Actinomadura sp. A-49
- Actinomadura sp. A-5
- Streptomyces albireticuli SA-12
- Streptomyces olivoreticuli SO-14
- Streptomyces olivoreticuli SO-23
- Streptomyces olivoreticuli SO-4
- Streptomyces olivoreticuli SO-55
- Streptomyces olivoreticuli SO-89
- Streptomyces sp. L-10
- Streptomyces sp. L-18
- Streptomyces sp. L-19
- Streptomyces sp. L-20
- Streptomyces sp. L-6
- Streptomyces sp. L-7
- Streptomyces sp. L-8
- Streptomyces sp. L-9
- Bacillus velezensis 11
- Micrococcus luteus 50
- Micrococcus luteus 511
- Micrococcus luteus P1
- Micrococcus luteus P2
- Micrococcus luteus P3
- Micrococcus luteus P4
- Micrococcus luteus P5
- Micrococcus luteus P6
- Micrococcus luteus RS10
- Micrococcus luteus RS5
- Micrococcus luteus RS6
- Micrococcus luteus RS7
- Micrococcus luteus RS8
- Micrococcus luteus RS9
- Streptomyces monomycini A-6
- Streptomyces sp. 1-5
- Streptomyces sp. 103
- Streptomyces sp. 107
- Streptomyces sp. 208
- Streptomyces sp. 701
- Streptomyces sp. 71
- Streptomyces sp. 9-0
- Streptomyces sp. 9-2
- Streptomyces sp. 9-4
- Streptomyces sp. 9-8
- Streptomyces sp. 9057
- Streptomyces sp. 9073
- Streptomyces sp. 9278
- Streptomyces sp. B-32
- D1 IGH
- D1 IGL
- D16 IGH
- D16 IGK
- L1 IGH
- L1 IGK
- TA4 IGH
- TA4 IGK
- TA9 IGH
- TA9 IGK
- V1 IGH
- V1 IGK
28 Сентября 2021 года 31 Декабря 2023 года
Список публикаций по проекту
- (2022). Deep Functional Profiling of Wild Animal Microbiomes Reveals Probiotic Bacillus pumilus Strains with a Common Biosynthetic Fingerprint. Int J Mol Sci 23 (3), 1168
- (2022). 7,8-Dihydro-8-oxo-1,N6-ethenoadenine: an exclusively Hoogsteen-paired thymine mimic in DNA that induces A→T transversions in Escherichia coli. Nucleic Acids Res 50 (6), 3056–3069
- (2022). Mechanism of Action and Therapeutic Potential of the β-Hairpin Antimicrobial Peptide Capitellacin from the Marine Polychaeta Capitella teleta. Mar Drugs 20 (3),
- (2022). Features, modulation and analysis of glycosylation patterns of therapeutic recombinant immunoglobulin A. Biotechnol Genet Eng Rev 38 (2), 1–23
- (2022). Novel β-Hairpin Peptide from Marine Polychaeta with a High Efficacy against Gram-Negative Pathogens. Mar Drugs 20 (8),
- (2022). An ELISA Platform for the Quantitative Analysis of SARS-CoV-2 RBD-neutralizing Antibodies As an Alternative to Monitoring of the Virus-Neutralizing Activity. Acta Naturae 14 (3), 109–119
- (2023). Co-expression of different proteins in Escherichia coli using plasmids with identical origins of replication. Biochem Biophys Res Commun 641, 57–60
- (2022). Amicoumacin-based prodrug development approach. Bulletin of Russian State Medical University 6 (2022), 99–105
- (2022). The Fallout of Catastrophic Technogenic Emissions of Toxic Gases Can Negatively Affect Covid-19 Clinical Course. Acta Naturae 14 (4), 101–110
- (2022). Drug design strategies for the treatment of coronavirus infection. Bulletin of Russian State Medical University 6 (6), 126–128
- (2022). Subpopulation Heterogeneity of NK Cells during the Genetic Modification for Subsequent Use in Targeted Therapy. Dokl Biochem Biophys 507 (1), 380–382
- (2022). Differences in Presentation of SARS-CoV-2 Omicron Strain Variant BA.1–BA.5 Peptides by HLA Molecules. Dokl Biochem Biophys 507 (1), 298–301
- (2023). Optimization of recombinant antibody production based on the vector design and the level of metabolites for generation of Ig- producing stable cell lines. J Genet Eng Biotechnol 21 (1), 23
- (2023). Multicomponent Lipid Nanoparticles for RNA Transfection. Pharmaceutics 15 (4),
- (2023). A Route to Synthesize Ionizable Lipid ALC-0315, a Key Component of the mRNA Vaccine Lipid Matrix. Russ. J. Bioorganic Chem. 49 (2), 412–415
- (2023). Antiviral Activity of Singlet Oxygen-Photogenerating Perylene Compounds Against SARS-CoV-2: Interaction with the Viral Envelope and Photodynamic Virion Inactivation. Virus Res 334, 199158
- (2023). KDM5 Family Demethylase Inhibitor KDOAM-25 Reduces Entry of SARS-CoV-2 Pseudotyped Viral Particles into Cells. Bull Exp Biol Med 175 (1), 150–156
- (2023). Identification of Significant RNA-Binding Proteins in the Process of CD44 Splicing Using the Boosted Beta Regression Algorithm. Dokl Biochem Biophys 510 (1), 99–103
- (2023). Recent Advances in Molecular Mechanisms of Nucleoside Antivirals. Curr Issues Mol Biol 45 (8), 6851–6879
- (2023). Synthesis of Liposomes Conjugated with CpG-Oligonucleotide and Loaded with a Set of T-Cell Epitopes of the SARS-CoV-2 Virus. Russ. J. Bioorganic Chem. 49 (4), 905–911
- (2023). Near-Infrared Dyes: Towards Broad-Spectrum Antivirals. Int J Mol Sci 24 (1), 188
- (2022). Antibiotics from Insect-Associated Actinobacteria. Biology (Basel) 11 (11), 1676
- (2022). Hydrophobic Rose Bengal Derivatives Exhibit Submicromolar-to-Subnanomolar Activity against Enveloped Viruses. Biomolecules 12 (11), 1609
- (2023). Characterization of a novel natural tetracenomycin reveals crucial role of 4-hydroxy group in ribosome binding. Biochimie 206, 150–153
- (2023). Condensates of SARS-CoV-2 Nucleoprotein on Viral RNA and Their Small Molecule Modulators (A Review). Russ. J. Bioorganic Chem. 49 (5), 917–929
- (2023). Membrane-Targeting Perylenylethynylphenols Inactivate Medically Important Coronaviruses via the Singlet Oxygen Photogeneration Mechanism. Molecules 28 (17), 6278
- (2023). Synthesis of 5-Halo-2ʹ-Azido Derivatives of Cytidine and N-Hydroxycytidine and Evaluation of Their Antiviral Activity on a Panel of RNA Viruses, Including SARS-CoV-2. Russ. J. Bioorganic Chem. 49 (6), 1475–1482
- (2023). Introduction of Carbonyl Groups into Antibodies. Molecules 28 (23), 7890
- (2023). Immunocompetent Mice As a Model for Preclinical Studies of mRNA Vaccine Immunogenicity. Dokl Biochem Biophys 512 (1), 266–269
- (2023). Novel BRICHOS-Related Antimicrobial Peptides from the Marine Worm Heteromastus filiformis: Transcriptome Mining, Synthesis, Biological Activities, and Therapeutic Potential. Mar Drugs 21 (12), 639
- (2024). Immunoliposomes As a Promising Antiviral Agent against SARS-CoV-2. Dokl Biochem Biophys 514 (1), 6–10
- (2023). BODIPY Dye Derivative for Irreversible Fluorescent Labeling of Eukaryotic Cells and Their Simultaneous Cytometric Analysis. Acta Naturae 15 (4), 92–99
- (2024). CCR5/CXCR3 antagonist TAK-779 prevents diffuse alveolar damage of the lung in the murine model of the acute respiratory distress syndrome. Front Pharmacol 15, 1351655