Пресс-центр / Дайджест
RALF пептиды регулируют иммунный ответ у мха Physcomitrium patens
Растения используют малые секретируемые пептиды в качестве важных медиаторов многих процессов, от роста и развития до реакции на стрессовые условия. Одним из таких регуляторов является семейство консервативных цистеин-богатых 5 кДа пептидов RALF (Rapid Alkalinization Factor), широко представленных у наземных растений. Сотрудники Лаборатории системного анализа белков и пептидов ИБХ РАН совместно с коллегами из МГУ, РУДН, ФХМ и МФТИ показали, что пептидные фитогормоны RALF (Rapid Alkalinization Factor) регулируют иммунный ответ у мха Physcomitrium patens. Данное исследование расширяет наши знания о адаптационную значимости и консервативности функций пептидов RALF у наземных растений. Работа опубликована в журнале Frontiers in Plant Science (IF=6.6). Подробнее
Нефункциональные клонотипы являются естественными вложенными контролями в репертуарах Т и B-клеточных рецепторов
Сотрудники Отдела геномики адаптивного иммунитета ИБХ РАН совместно с коллегами из НМИЦ ДГОИ им. Рогачева разработали первый полностью вычислительный метод для коррекции количественных перекосов в репертуарах генов Т и B-клеточных рецепторов (TCR и BCR), полученных с применением мультиплексной ПЦР. Такие количественные перекосы связаны с неоднородностью эффективностей праймеров и экспоненциальным характером ПЦР. В ходе данного исследования выявлены специфические для мультиплексных ПЦР аномалии в частотах сегментов, входящих в состав нефункциональных перестроек TCR и BCR. Для количественной оценки таких аномалий были предложены коэффициенты OAR, на основе которых был создан алгоритм коррекции количественных перекосов. Эффективность алгоритма подтверждена рядом независимых экспериментов. Работа опубликована в журнале eLife.
Конъюгаты фрагментов антител с лекарствами селективно уничтожают GD2-экспрессирующие опухолевые клетки
Использование фрагментов антител вместо полноразмерных антител в конъюгатах с лекарствами способно ускорить накопление терапевтических молекул в опухоли и снизить их побочные эффекты. Сотрудники Лаборатории молекулярной иммунологии совместно с коллегами из Лаборатории клеточных взаимодействий и Лаборатории молекулярной диагностики ИБХ РАН, а также из других российских институтов, впервые получили конъюгаты фрагментов GD2- специфичных антител с лекарствами. Конъюгаты миниантител и scFv-фрагментов антител с тубулин-ингибирующими препаратами MMAE и MMAF проявили сильные цитотоксические и цитостатические эффекты в GD2-положительных линиях нейробластомы и меланомы. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences. Подробнее
Получена серия противовирусных соединений на основе 5-(перилен-3-илэтинил)урацила и изучен их механизм действия
Группа учёных из Лаборатории молекулярного дизайна и синтеза, Группы экспрессии белковых факторов роста и дифференцировки ИБХ РАН, Института полиомиелита и других институтов синтезировали серию соединений на основе 5-(перилен-3-илэтинил)урацила и изучили их противовирусные свойства и механизм действия. Предыдущие исследования данного класса соединений предполагали противоречащие типы механизмов действия при сопоставимо высокой активности. Настоящее исследование показало, что при облучении светом амфифильные соединения, аккумулированные в клеточных и вирусных мембранах, ингибируют проникновение в клетку оболочечных вирусов. Исследование опубликовано в журнале Antiviral Research. Подробнее
Профаговые области в куртобактериальных геномах: мал золотник, да дорог
Curtobacterium — род грамположительных бактерий порядка Actinomycetales. Некоторые виды Curtobacterium являются патогенами сельскохозяйственных культур, таких как соя, сухие бобы, горох, сахарная свекла и столовая свекла, которые встречаются во всем мире. Около 200 геномов видов Curtobacterium, включая метагеномные последовательности, были проверены на наличие последовательностей возможного профагового происхождения. Один из предсказанных умеренных фагов был индуцирован из генома Curtobacterium. Биоинформатический анализ смоделированных белков, кодируемых в областях, происходящих от профагов, привел к обнаружению около 100 ферментов, разрушающих гликополимеры. Эти белки могут быть рассмотрены для экспериментального дизайна новых антибактериальных средств против фитопатогенов Curtobacterium. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences. Подробнее