Пресс-центр / Дайджест
Разработан метод выявления опухолей по анализу плазмы крови
Сотрудники Отдела геномики адаптивного иммунитета ИБХ РАН с коллегами из РНИМУ им. Н.И.Пирогова, НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина и ФЦМН ФМБА разработали метод обнаружения опухолей в организме человека по особенностям структуры концов фрагментов свободно циркулирующей ДНК крови (сцДНК). Исследователи изучили концевые участки сцДНК в определённых регионах генома с высоким разрешением, и на основе их последовательностей и положения в геноме смогли различить образцы крови, полученные от здоровых и больных доноров в группе из 175 человек. Разработанный метод профилирования концов сцДНК позволяет обнаружить колоректальный рак и рак почки по образцу плазмы крови уже на ранних стадиях заболевания. Работа опубликована в журнале Molecular Cancer.
Фосфолипазы А2 из ядов змей ингибируют репликацию ВИЧ
С начала эпидемии ВИЧ, длящейся более 30 лет, основной целью ученых была разработка эффективных методов профилактики и лечения ВИЧ-инфекции, в том числе и поиск новых соединений, обладающих высокой активностью против ВИЧ. Исследования, проведенные сотрудниками Отдела молекулярной нейроиммунной сигнализации ИБХ РАН и НИЦЭМ им. Н.Ф.Гамалеи, показали, что фосфолипазы А2 (PLA2) из змеиного яда обладают выраженным анти-ВИЧ эффектом. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences. Подробнее
Учет В-клеточной компоненты и нормировка на инфильтрацию опухолевой ткани позволяет предсказать ответ на анти-PD-L1 иммунотерапию при раке мочевого пузыря
Опухоль-инфильтрирующие В-клетки являются важной компонентой опухолевого микроокружения. Ученые из Отдела геномики адаптивного иммунитета ИБХ РАН показали, что высокая пропорция продуцируемых в опухолевом окружении IgG1/IgA изотипов антител является важным прогностическим фактором для определенных подтипов рака мочевого пузыря, и также ассоциируется с повышенной экспрессией цитотоксических генов. Для более точного прогноза и предикции ответа на иммунотерапию, авторы также нормировали экспрессию цитотоксических генов на инфильтрацию опухолевого образца иммунными клетками. Разработанная модель PRIMUS, объединившая нормированную цитотоксическую, а также B- и NK-клеточные сигнатуры, позволила с беспрецедентной точностью определять пациентов, отвечающих на анти-PD-L1 иммунотерапию. Работа опубликована в журнале Cancer Immunology Research.
Повышенная чувствительность CD57-негативных NK-клеток, экспрессирующих KIR2DL2/3 и NKG2C, к iCasp9-ретровирусной трансдукции: взаимосвязь с пролиферативным потенциалом, степенью активации и индукции сигнала смерти
Клеточная терапия на основе генномодифицированных NK-клеток является многообещающей стратегией лечения рака, однако гетерогенность NK-клеток ограничивает возможности такого подхода. Сотрудники Лаборатории клеточных взаимодействий ИБХ РАН продемонстрировали различия субпопуляций NK-клеток по восприимчивости к ретровирусной трансдукции гена индуцируемой каспазы 9 (iCasp9), встраивание которого может позволить своевременно и быстро запустить апоптоз iCasp9-NK-клеток при добавлении специального индуктора в случае их чрезмерной гиперактивности. Наибольшая эффективность трансдукции была зарегистрирована в субпопуляции NK-клеток CD57–KIR2DL2/3+NKG2C+, которую отличал увеличенный пролиферативный потенциал и повышенный уровень экспрессии маркера активации HLA-DR. В то же время, среди iCasp9-популяций, NK-клетки KIR2DL2/3+ наиболее слабо реагировали на индукцию апоптоза. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences.
На пути к общему подходу к прототипированию терапевтически значимых пептидов и белков в бесклеточной системе трансляции
Ученые из Квинслендского технологического университета и Университета Квинсленда (Австралия), при участии сотрудника группы молекулярных инструментов для исследования живых систем ИБХ, разработали термодинамически контролируемый способ фолдинга пептидов и белков, синтезируемых in vitro и содержащих большое количество дисульфидных связей, с использованием условий, препятствующих агрегации. С этой целью система трансляции in vitro на основе E. coli была модифицирована так, чтобы обеспечивать одновременный с трансляцией «захват» транслируемых продуктов с помощью аффинной смолы. Данный подход снижает степень агрегации (поли)пептидов и обеспечивает эффективный окислительный фолдинг под термодинамическим контролем. Разработанный подход может найти применение для прототипирования широкого спектра пептидов, синтез которых ограничен наличием дисульфидных связей, макроциклических пептидов с неприродными связями и фрагментов антител в количествах, достаточных для анализа взаимодействия и оценки биологической активности. Работа опубликована в журнале Nature Communications (IF 14.919).