Ефремов Роман Гербертович
![]() |
Профессор, Доктор наук Заместитель директора по науке (Дирекция), Главный научный сотрудник (Лаборатория моделирования биомолекулярных систем), Ведущий научный сотрудник (Группа спектрального анализа) Методическая комиссия, Диссертационный совет, Ученый совет, Аттестационная комиссия |
Работа по профессии
1983: инженер, Отдел инструментальных методов анализа, Институт биоорганической химии им. М. М. Шемякина АН СССР;
1983—1986: аспирант, Факультет экспериментальной и теоретической физики МИФИ;
1986—2007: научный сотрудник, старший научный сотрудник, ведущий научный сотрудник ИБХ РАН;
2007-н. вр.: руководитель подразделения (зав. Лабораторией моделирования биомолекулярных систем), зам. директора ИБХ РАН по научной работе;
1992—1997: приглашенный профессор в Университете г. Реймс и Университете г. Лилль (Франция);
1998-н. вр.: старший научный сотрудник, ведущий научный сотрудник Межведомственного суперкомпьютерного центра РАН (МСЦ РАН);
2001-н. вр.: доцент кафедры биоинженерии Биологического ф-та МГУ им. М. В. Ломоносова.
Преподавательская деятельность
1987—1991: лабораторные занятия по оптическим методам и обработке спектральных данных для студентов МФТИ на базе УНЦ ИБХ АН СССР.
1993—1996: цикл лекций (50 часов) «Эмпирические методы в компьютерном моделировании молекул» для студентов Высшей Школы инженеров (Лилль, Франция), специализирующихся по молекулярной инженерии.
1997-н. вр.: курс лекций по молекулярному моделированию биополимеров для студентов 6 курса ф-та молекулярной и биологической физики МФТИ (на базе УНЦ ИБХ РАН).
1999-н. вр.: курс лекций по молекулярному моделированию биополимеров для студентов 5 курса ф-та молекулярной и биологической физики МФТИ (на базе МСЦ РАН).
2001-н. вр.: курс лекций по молекулярному моделированию для студентов 2 и 3 курсов кафедры биоинженерии Биологического ф-та МГУ.
Руководитель 6 кандидатских диссертаций.
1993: Премия Европейской Академии (Academiae Europaeae) для молодых ученых РФ;
2001—2002, 2005: Стипендия Фонда содействия российской науке для молодых докторов наук.
Образование
Период обучения | Страна, город | Учебное заведение | Дополнительная информация |
---|---|---|---|
1970–2007 | Россия, Москва | Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова (МГУ), Биологический факультет | Присвоено ученое звание профессора по специальности «биофизика». |
1970–1999 | Россия, Москва | Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова (МГУ), Биологический факультет | Диплом доктора физико-математических наук (тема диссертации: «Молекулярное моделирование мембрано-связанных участков белков и пептидов») |
1970–1986 | Россия, Москва | Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова (МГУ), Биологический факультет | Диплом кандидата физико-математических наук (тема диссертации: «Топография и микроокружение хромофоров в бактериальном и зрительном родопсинах (спектроскопия комбинационного рассеяния света и квантовохимические расчеты)») |
1977–1983 | Россия, Москва | Московский инженерно-физический институт (МИФИ), Факультет экспериментальной и теоретической физики | Диплом с отличием (тема: «Математические методы определения вторичной структуры белков и полипептидов на основании спектров КР и полуэмпирических расчетов») |
Работа в ИБХ
2018–наст.вр. | Главный научный сотрудник | Лаборатория моделирования биомолекулярных систем |
2018–наст.вр. | Ведущий научный сотрудник | Группа спектрального анализа |
2021–наст.вр. | Заместитель директора по науке | Дирекция |
Членство в советах и комиссиях ИБХ
Методическая комиссия | |
Диссертационный совет | |
Ученый совет | |
Аттестационная комиссия |
Степени и звания
Профессор | |
Доктор наук (Физико-математические науки, 03.00.02 — Биофизика) | |
Научные результаты
Основные труды посвящены разработке и применению новых подходов в исследовании пространственной структуры белков и пептидов с помощью оптической спектроскопии и молекулярного моделирования. Результаты исследований опубликованы в более чем 100 статьях в реферируемых журналах.
1985—1992. Серия исследований, посвященных разработке методов спектроскопии резонансного (РКР) и гигантского (ГКР) комбинационного рассеяния пептидов и белков. Впервые получены спектры ГКР мембранных белков — бактериального и зрительного родопсинов. На основании спектральных данных и результатов квантовохимических расчетов исследована топология их хромофор-связывающих центров. Для ряда мембранных белков зарегистрированы первые спектры РКР с возбуждением в УФ-области, предложены высокоэффективные методы цифровой обработки сигналов в спектрах РКР белков.
1992—1997. Выполнена серия работ по молекулярному моделированию структуры трансмембранного (ТМ) домена Na,K-АТФазы. Для этого впервые применен метод детального картирования гидрофобных/гидрофильных свойств ТМ спиралей с помощью метода молекулярного гидрофобного потенциала (МГП). МГП-подход также был успешно использован для изучения гидрофобной организации целого ряда водорастворимых и мембранных белков и пептидов.
1997—2001. Разработана оригинальная теоретическая модель неявно заданной мембраны, предназначенная для исследования поведения пептидов и белков в мембрано-подобном окружении. Результаты вычислений, выполненных для большого набора трансмембранных и периферических пептидов, продемонстрировали хорошее согласие с данными экспериментов.
2002-н. вр. Разработка новейших многоуровневых подходов в компьютерном моделировании пептидов и белков в мембранах различного состава и в водном растворе, в исследовании межмолекулярных взаимодействий белок-белок, белок-мембрана и белок-лиганд. Применение созданных методов в исследовании периферических и интегральных мембранных белков, мембрано-активных пептидов, в рациональном молекулярном конструировании новых биологически активных соединений с заданными свойствами, действующих в т. ч. и на мишени в мембранах клеток. Создание единого информационно-вычислительного комплекса для высокопроизводительного молекулярного моделирования белков и пептидов.
Членство в сообществах
Член редколлегии журналов «Биоорганическая химия», Москва; «The Open Structural Biology Journal», «The Open Bioinformatics Journal».
Член Ученого Совета ИБХ РАН.
Член специализированных диссертационных советов (МГУ, ГУ НИИ БМХ РАМН).


