Родился 4 июля 1970 года в городе Жуковский Московская области. В 1993 году закончил факультет Физико-Химической Биологии МФТИ. Дипломная работа “Пространственная структура трансмембранных сегментов C, Е и G бактериоопсина по данным двумерной спектроскопии 1H-ЯМР” была выполнена в группе ЯМР Лаборатории Спектрального Анализа ИБХ РАН. Закончив аспирантуру ИБХ РАН, Бочаров Э.В. в 1998 году защитил кандидатскую диссертацию на тему "Пространственная структура и динамика белка L7 из рибосомы Escherichia coli" (специальность 02.00.10 – Биоорганическая химия). 1999-2003 г.г., приглашённый ученый (visiting scientist) в Шведском ЯМР-центре Университета г. Гетеборг (руководитель проф. д-р. М.Биллитер). С 2002 года старший научный сотрудник лаборатории Биомолекулярной ЯМР-спектроскопии отдела Структурной Биологии (руководитель проф. д-р. А.С.Арсеньев) ИБХ РАН.

Персональные гранты и стипендии: 1992-1993 г.г., студенческие стипендии мэра г. Москвы; 1995-1997 г.г., аспирантские стипендии научно-образовательной программы “Фонда Сороса”; 2000-2003 г.г., государственные стипендии РФ “Выдающийся молодой ученый”; 2004-2005 г.г., грант Президента Российской Федерации для государственной поддержки молодых российских ученых. 

Образование

Период обучения	Страна, город	Учебное заведение	Дополнительная информация
1993–1997	Москва	аспирантура ИБХ РАН
1987–1993	Долгопрудный	ФФХБ МФТИ

Работа

Период работы	Страна, город	Название компании	Дополнительная информация
2002–наст.вр.	Москва	ИБХ РАН	старший научный сотрудник
1999–2002	Москва	ИБХ РАН	научный сотрудник

Работа в ИБХ

2002–наст.вр.

Старший научный сотрудник

Лаборатория биомолекулярной ЯМР-спектроскопии

Степени и звания

2024	Доктор наук (Физико-математические науки, 1.5.2. — Биофизика)
1998	Кандидат наук (Химические науки, 02.00.10 — Биоорганическая химия)

Навыки

Методы гетероядерной ЯМР-спектроскопии высокого разрешения и молекулярного моделирования для исследования структуры и динамики низкомолекулярных соединений и биологических макромолекул.

Научные интересы

Научные интересы относятся к области структурно-динамических исследований белков и их комплексов с биомолекулами (липидами, ДНК, РНК и т.д.) методами гетероядерной ЯМР-спектроскопии высокого разрешениям в интеграции с другими методами структурной биологии и биофизики. Разработка новых методик ЯМР-спектроскопии для изучения подвижных белковых комплексов.

Основные работы посвящены исследованиям молекулярных механизмов биологической активности мембранных и мембраноактивных белков в норме и при патогенезе различных заболеваний человека (в том числе, онкологических и нейродегенеративных). В последние годы основные исследования направлены на установление биофизических принципов проведения сигнала рецепторами через мембрану клетки, а также функционирования мембранных белков в макромолекулярных комплексах. Особое внимание уделяется изучению аллостерических конформационных перестроек, белок-белковых и белок-липидных взаимодействий компонент цитохром Р450-зависимых систем, рецепторных тирозинкиназ (РТК) и РТК-подобных рецепторов, белка-предшественника β-амилоида (мутации в которых связаны с онкогенезом и болезнью Альцгеймера) для разработки перспективных лекарственных соединений. В то же время, часть работ направлена на исследования структурно-динамических свойств растворимых белков и их комплексов, в том числе рибосомных белков, цитокинов, цитохромов, гистоноподобных HU-белков из патогенных бактерий, пептидных и белковых токсинов из растений и животных.

Реализация научных Проектов в качестве Руководителя:

• 2001 г., РФФИ 01-04-48651-а и 01-04-06130-мас по теме «Пространственная структура и динамика рибосомного белка L7/L12 из Еsсhеriсhiа соli в растворе»;
• 2001-2002 г.г., РФФИ 01-04-06130-мас и 02-04-06650-мас «Исследование фемто- микросекундной внутримолекулярной динамики белков с использованием новых методов гетероядерной спектроскопии ЯМР»;
• 2003 г., РФФИ 03-04-06408-мас «Исследование взаимосвязи пространственной структуры и внутримолекулярной подвижности биологически активных полипептидов с их функцией»;
• 2003-2005 г.г., РФФИ 03-04-49011-а «Учет конформационной подвижности при описании электростатических взаимодействий в белках с помощью новых методов гетероядерной спектроскопии ЯМР и молекулярной динамики»;
• 2006-2008 г.г., РФФИ 06-04-49740-а «Структурно-динамические исследования трансмембранных доменов рецепторных протеинкиназ современными методами гетероядерной спектроскопии ЯМР и молекулярной динамики»;
• 2009-2011 г.г., РФФИ 09-04-00551-а «Структурно-динамический анализ специфических взаимодействий трансмембранных доменов рецепторных тирозинкиназ в норме и патологии»;
• 2012-2014 г.г., РФФИ 12-04-01816-а «Структурные, кинетические и термодинамические аспекты специфических взаимодействий трансмембранных доменов рецепторных тирозинкиназ в норме и патологии»;
• 2015-2017 г.г., РФФИ 15-04-07983-а «Установление молекулярных механизмов влияния патогенных мутаций в трансмембранных доменах на активность рецепторных тирозинкиназ»;
• 2018-2020 г.г., РФФИ 18-04-01289-а «Структурные аспекты воздействия онкогенных мутаций в трансмембранных доменах рецепторных тирозинкиназ на проведение сигнала через мембрану клетки»;
• 2020-2022 г.г., РФФИ 20-54-00041-Бел-а «Анализ взаимодействия мембран-связанных компонентов цитохром P450-зависимых систем человека с использованием методов интегративной структурной биологии»;
• 2020-2022 г.г., РНФ 20-64-46027 «Структурно-динамические исследования внутри- и межмолекулярных взаимодействий амилоидогенных пептидов и их предшественников для установления молекулярных механизмов патогенеза и разработки таргетных методов терапии нейродегенеративных заболеваний»;
• 2023-2025 г.г., РНФ 23-44-10021 (международный, совместно с БРФФИ) «Конформационная динамика в образовании и функционировании биомакромолекулярных комплексов для биомедицинских и фармацевтических разработок».

Научные результаты

С помощью комплексного подхода на основе гетероядерной ЯМР-спектроскопии в интеграции взаимодополняющих методов структурной биологии, биохимии и биофизики были раскрыты молекулярные механизмы функционирования для целого ряда белков из различных биологических систем и предложены способы воздействия на их биологическую активность. Предложен липид-опосредованный механизм передачи сигнала через липидную мембрану рецепторами I-го типа. Описаны молекулярные механизмы для ряда патогенных мутаций в мембранных белках, ответственных за онкогенные и нейродегенеративные заболевания. Разработаны передовые методики для ЯМР-исследований белков и их макромолекулярных комплексов.

Установлено более 40 пространственных структур мембранных и растворимых белков, расшифрован ряд структур низкомолекулярных соединений. Автор более 100 научных статей и монографий с H-index=28 и общей цитируемостью более 2000 (в соответствии с WoS & Scopus). 

В результате передовых исследований мембранных белков вместе с коллегами впервые были описаны структурно-динамические свойства и специфическая ассоциация ТМ доменов дикого типа и мутантных форм проапоптозного белка BNIP3, белка-предшественника β-амилоида и РТК-подобных рецепторов, принадлежащих семействам рецепторов фактора роста фибробластов FGFR, рецепторов эфринов EphR, рецепторов эпидермальных факторов роста EGFR/ErbB/HER1-4, рецепторов тромбоцитарного фактора роста PDGFR, рецепторов инсулина InsR/IRR/EGFIR, а также рецептора гормона роста человека hGHR, ассоциированного с внутриклеточной JAK2 киназой.

За последние 5 лет (с 2018 г.) проведены пионерские исследования липид-опосредованного механизма передачи сигнала через мембрану клетки: из сопоставления полученных данных о конформационном поведении ТМ доменов РТК из различных семейств с литературными данными для лиганд-связывающих, примембранных и киназных доменов предложен новый механизм передачи сигнала РТК через мембрану клетки посредством согласованных белок-белкового и белок-липидного взаимодействий. Более того, с помощью методов структурной биологии была изучена конформационная динамика полноразмерного инсулиноподобного рецептора IRR в мембранном окружении.

Вместе с российскими и французскими коллегами проведены пионерские исследования мембраносвязанной нейраминидазы NEU1 из организма человека, при которых предложены и протестированы трансмембранные пептиды, ингибирующие биологическую активность данного фермента, что важно для терапии ряда заболеваний.

Вместе с российскими и немецкими коллегами проведены исследования механизмов межмолекулярных взаимодействий пептидов β-амилоида Aβ и мембранных фрагментов APP (субстратов мембранных секретаз, предшественников Aβ) с их молекулярными мишенями и фармакологическими соединениями перспективными для терапии болезни Альцгеймера. Так был раскрыт молекулярный механизм развития болезни Альцгеймера, связанный с влиянием семейной «Австралийской» мутации L723P на структурно-динамические свойства ТМ сегмента белка-предшественника β-амилоида (АРР). Также продемонстрировано, что D-энантиомерный пептид D3, разработанный для терапии болезни Альцгеймера и показавший свою эффективность in vitro и in vivo в предотвращении токсичной олигомеризации Aβ, динамически взаимодействует с прилегающей к мембране областью белка APP, содержащей амилоидогенную область Aβ.

Кроме того, для изучения высокоподвижных белков с изменяемой конформацией, таких как тау-белок, избыточное фосфорилирование которого при болезнях Альцгеймера и Паркинсона приводит к образованию нейрофибриллярных клубков и патологий микротрубочек, была разработана новая методика гетероядерной ЯМР-спектроскопии высокого разрешения FOSY (FOcused SpectroscopY), которая позволяет проводить экспресс-анализ ЯМР-сигналов только для функционально важных внутренне-неупорядоченных (IDP) участков мембранных и растворимых белков. 

Членство в сообществах

Российское общество Биохимиков и Молекулярных Биологов, Biophysical society, FEBS.