Лаборатория биоинформационных методов комбинаторной химии и биологии
Отдел функционирования живых систем Руководитель: Андреев Д.Е. |
Лаборатория была создана в 2019 году. Лаборатория занимается анализом и обработкой высокопропускных геномных и пост-геномных данных (полнотранкриптомное секвенирование, рибосомное профилирование, масс спектрометрические данные) для обнаружения новых белок-кодирующих последовательностей и изучения функциональных свойств их продуктов. Для этих целей лабораытория также использует филогенетические подходы и моделирование структур белковых молекул.
Лаборатория тесно сотрудничает с лабораторией ЛАПТИ в г. Корк, Ирландия.
- Изучение механизмов регуляции генной экспрессии и белкового синтеза.
- Oбнаружение и изучение транслируемых участков геномов и транскриптомов, включая кодирующие новые белки и протеоформы.
- Изучение природного разнообразие генетического декодирования.
- Разработка програмного обеспечения для анализа биологических данных.
- Разработка вычислительных методов для поиска новых биоактивных молекул на основе скрининга комбинаторных пептидных библиотек.
- Молекулярное моделирование белковых структур и пептид-белковых взаимодействий.
Был обнаружен и охарактеризован POLGARF, продукт не-АУГ инициируемой трансляции открытой рамки считывания перекрывающейся с белок кодирующей последовательностью гена POLG кодирующего митохондриальную ДНК полимеразу (Loughran et al doi: 10.1101/2020.03.06.980391).
ФИО | Должность | Контакты |
---|---|---|
Андреев Д.Е., д.х.н. | г.н.с. | |
Северинов К.В., д.apx. | г.н.с. | |
Буданов А.В., д.apx. | в.н.с. | |
Головин А.В. | в.н.с. | |
Ковальчук Сергей Игоревич, к.х.н. | с.н.с. | xerx222@gmail.com |
Порозов Ю.Б. | с.н.с. | |
Бачева А.В. | н.с. | |
Мокрушина Юлиана Анатольевна | н.с. | |
Мордовкина Д.А. | н.с. | |
Герасева Е.П. | м.н.с. | |
Евсеева М.Н. | м.н.с. | |
Соловьев Ярослав Владимирович | м.н.с. | |
Шафиков Р.Р. | м.н.с. | |
Маслова В.Д. | инж.-иссл. | |
Хвостиков Тимофей Сергеевич | асп. | |
Владыкина М.В. | тех.-лаб. | |
Друсалевич О.В. | тех.-лаб. | |
Качкин Ф.Ю. | тех.-лаб. | |
Мурзин В.А. | тех.-лаб. | |
Соболев Д.И. | тех.-лаб. |