Сегодня программа подготовки включает в себя освещение таких фундаментальных проблем данной области, как структура и функции биополимеров, генная и белковая инженерия, биотехнология, молекулярные основы иммунологии, структура и функции биологических мембран, а также прикладная информатика. Большое внимание уделяется освоению студентами передовых методов исследования строения молекул и механизмов их биологического действия.

Ежегодно в УНЦ ИБХ РАН проходят обучение более 250 студентов старших курсов ряда высших учебных заведений Российской Федерации. Наиболее тесное взаимодействие осуществляется с двумя базовыми кафедрами: кафедрой биоорганической химии биологического факультета МГУ им. М. В. Ломоносова (зав. кафедрой академик В. Т. Иванов) и кафедрой физико-химической биологии и биотехнологии факультета молекулярной и биологической физики Московского физико-технического института (зав. кафедрой профессор А. С. Арсеньев).

Полная программа обучения в УНЦ включает чтение специальных лекционных курсов с отчетностью в виде зачетов и экзаменов, выполнение лабораторных работ в рамках больших практикумов по основным направлениям физико-химической биологии и биотехнологии и проведение научно-исследовательской работы по тематике ИБХ РАН. Наличие лабораторных практикумов является отличительной особенностью учебного процесса в УНЦ ИБХ. При подготовке студентов к условиям реального научного исследования особое значение придается освоению ими основных навыков и приемов экспериментальной работы. Лабораторные практикумы в УНЦ ИБХ РАН по соотношению учебных часов сопоставимы с основными лекционными курсами. С целью обеспечения наиболее эффективной передачи навыков практической работы в научной лаборатории практические занятия проводятся с небольшими группами — не более 4—5 студентов, что максимально приближено к индивидуальной форме освоения учебной программы. В лабораторных практикумах используется уникальный парк научного оборудования Института, что обеспечивает не только возможность освоения студентами вузов новейших экспериментальных методов, но и полную безопасность при проведении этих работ как для учащихся, так и для окружающей среды.

После прохождения курса теоретической и практической подготовки в УНЦ студенты направляются в научно-исследовательские подразделения ИБХ РАН для выполнения курсовых и дипломных работ. Они имеют возможность работать над самыми актуальными научными проблемами, используют новейшее лабораторное оборудование, участвуют в научных семинарах и коллоквиумах. Лучшие студенческие исследования представляются на ежегодный конкурс научных работ молодых учёных и специалистов, а лучшие среди выпускников имеют возможность продолжить обучение в аспирантуре ИБХ РАН.

Научные сотрудники ИБХ РАН активно участвуют в учебной работе со студентами. Ведущие ученые Института читают студентам специальные лекционные курсы, принимают участие в проведении лабораторных спецпрактикумов, осуществляют научное руководство студенческими научно-исследовательскими работами. Среди них — действительные члены и члены-корреспонденты РАН, профессора, доктора и кандидаты наук, руководители подразделений и ведущие специалисты ИБХ РАН.

Учитывая многолетний вклад в подготовку квалифицированных научных кадров, директору Института академику В. Т. Иванову и руководителю УНЦ ИБХ РАН Т. В. Овчинниковой в 2007 г. присуждена премия Правительства Российской Федерации в области образования.