Исследование структурных основ внутриклеточной сигнализации Толл-подобных рецепторов методами спектроскопии ЯМР в растворе
Толл-подобные рецепторы (TLR) являются ключевыми участниками системы врожденного иммунитета. Активация TLR приводит к развитию иммунного ответа и воспаления, рецепторы семейства вовлечены в развитие ряда заболеваний, в том числе сепсиса, иммунодефицита, атеросклероза и астмы. Несмотря на кажущуюся ясность, в области структурной биологии толл-подобных рецепторов осталось много неотвеченных вопросов. Для получения необходимых данных следует рассмотреть исследования внутриклеточных (TIR) и трансмембранных (ТМ) доменов рецепторов TLR, в растворе методами ЯМР-спектроскопии высокого разрешения, что и предлагается в рамках Проекта. Предлагается разработать протоколы получения TIR доменов ряда TLR в бактериальных культурах в растворимой форме. Затем, выбрав наиболее перспективный TIR домен, планируется определить его пространственную структуру, изучить внутримолекулярную подвижность, взаимодействие с липидными мембранами различного состава, а также с ионами металлов. Это позволит описать поведение домена в окружении, близком к нативному. Исследования мембранной активности дадут возможность подтвердить или опровергнуть гипотезу о роли клеточной мембраны в процессах активации толл-подобных рецепторов. Для изучения устройства примембранных участков TLR будут получены пространственные структуры ТМ доменов с короткими примембранными регионами двух представителей семейства TLR в различном мембраноподобном окружении. Наконец, будет определена структура N-концевого домена MyD88, ключевого внутриклеточного партнера большинства TLR.
6 Января 2020 года 31 Декабря 2021 года
Список публикаций по проекту
- (2021). Sampling the cultivation parameter space for the bacterial production of TLR1 intracellular domain reveals the multiple optima. Protein Expr Purif 181, 105832
- (2021). Modulation of Toll-like receptor 1 intracellular domain structure and activity by Zn2+ ions. Commun Biol 4 (1), 1003