Происхождение, эволюция и разнообразие φ29-подобных фагов
Фаг φ29 и родственные ему бактериофаги в настоящее время являются наименьшими известными хвостатыми вирусами, инфицирующими различных представителей как грамположительных, так и грамотрицательных бактерий. В новой работе команды ученых из ИБХ РАН и других российских институтов был проведен поиск по общедоступным геномным базам данных, выявивший более 2000 последовательностей, которые разделяют характерные черты генома фага φ29. Анализ главных капсидных белков (MCP) φ29-подобных фагов показал их отличие от последовательностей MCP почти всех других известных групп Caudoviricetes и возможную отдаленную связь с MCP фагов, T7-подобных. HMM-поиск позволил обнаружить родство между φ29-подобными фагами и необычным лактококковым фагом KSY1 (Chopinvirus KSY1), геном которого содержит два гена РНК-полимеразы. Сочетание уникальных особенностей и отличительного происхождения фагов, родственных φ29, предполагает отнесение этой обширной группы к новому отряду или таксону более высокого ранга. Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences. Подробнее
october 11, 2024