Уникальный структурный фолд LonBA-протеазы из Bacillus subtilis – представителя вновь выявленного подсемейства Lon-протеаз
При исследовании АТР-зависимых Lon-протеаз – участников системы контроля качества клеточного протеома – сотрудниками Лаборатории химии протеолитических ферментов ИБХ РАН совместно с коллегами из Национального института онкологии (Фредерик, США) обнаружена группа ферментов, в которых сочетаются структурные особенности, присущие членам ранее изученных базовых подсемейств LonА и LonВ. Предложено рассматривать эти ферменты как новое «гибридное» подсемейство LonBA. Рентгеноструктурным анализом LonBA из Bacillus subtilis (BsLonBA) установлено, что протеазные (Р) домены ферментов нового подсемейства имеют уникальный для Lon- протеаз фолд. Экспериментально определенная структура Р-домена BsLonBA совмещена с модельной структурой АТР-азного компонента фермента, построенной с помощью программы AlphaFold2. Проведено сопоставление предсказанной структуры полноразмерной BsLonBA с известными структурами LonA- и LonB-протеаз. Обсуждаются возможные особенности функционирования LonBA-протеаз. Работа опубликована в International Journal of Molecular Sciences.
october 20, 2022